Proteomické přístupy ve vyhledávání biomarkerů a molekulární
klasifikaci nádorů prsu

p 2014

Proteomické přístupy ve vyhledávání biomarkerů a molekulární klasifikaci nádorů prsu

BOUCHAL, Pavel; Jakub FAKTOR; Josef MARYÁŠ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ et al.

Základní údaje

Originální název

Proteomické přístupy ve vyhledávání biomarkerů a molekulární klasifikaci nádorů prsu

Název česky

Proteomické přístupy ve vyhledávání biomarkerů a molekulární klasifikaci nádorů prsu

Název anglicky

Proteomics approaches in biomarker discovery and molecular classification of breast cancer

Autoři

BOUCHAL, Pavel; Jakub FAKTOR; Josef MARYÁŠ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Vendula PERNIKÁŘOVÁ; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL

Vydání

XXI. Biologické dny, Brno, 4.-5.9.2014, 2014

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Vyžádané přednášky

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-260-6793-1

Změněno: 16. 8. 2016 15:27, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Anotace

V originále

Nádory prsu jsou nejčastějším typem nádoru u žen. Současné diagnostické přístupy však stále vykazují nedokonalosti při určení rizika metastazování u skupiny luminal A, kdy malá část pacientek vykazuje v rozporu s teoretickou prognózou časné uzlinové metastáze. V našem projektu se snažíme identifikovat, validovat a charakterizovat specifické proteiny, mechanismy a metastatické molekulární portréty, které by byly použitelné v identifikaci pacientek s vyšším rizikem metastazování, a to na bázi proteomiky. V první fázi projektu jsme se zaměřili na vyhledávání prometastatických cílů v souboru 96 charakterizovaných nádorů prsu zahrnujícího stratifikaci vzorků podle grade, exprese hormonálních receptorů a stavu lymfatických uzlin. Primární proteomická studie byla založena na metodice zahrnující štěpení komplexních lyzátů trypsinem, značení peptidů isobarickými značkami (iTRAQ), separaci peptidů dvourozměrnou kapalinovou chromatografií a identifikaci a kvantifikaci proteinů na bázi vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS). Soubor 95 vybraných genů pak byl profilován na transkriptové úrovni. Statistika zahrnující Spearmanovu korelaci odhalila dva klastry související se stavem lymfatických uzlin u low garde karcinomů. Sada proteinů, změny jejichž exprese byly potvrzeny na proteinové i transkriptové úrovni, byla dále validována pomocí imunohistochemie. V další fázi výzkumného programu se zaměřujeme na klinickou validaci a funkční charakterizaci identifikovaných proteinů zejména ve vztahu k buněčné migraci a invazivitě a studium prometastatických mechanismů na molekulární úrovni. V rámci přednášky bude rovněž poskytnut přehled o nejnovějších proteomických metodách využitelných v dané oblasti výzkumu. Naše výsledky potvrzují, že molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu zahrnují aktivaci proteolýzy, NF-κB dráhy, změny v cytoskeletálních a adhezních proteinech a liší se od mechanismů známých u high-grade karcinomů. Práce je podporována projektem GAČR č. 14-19250S a Evropským fondem pro regionální rozvoj a státním rozpočtem České republiky (RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101).

Návaznosti

GA14-19250S, projekt VaV

Název: Nový panel proteinů korelujících se stavem lymfatických uzlin u low-grade nádorů prsu: Klinická verifikace a úloha v invazivitě nádorových buněk

Investor: Grantová agentura ČR, Nový panel proteinů korelujících se stavem lymfatických uzlin u low-grade nádorů prsu: Klinická verifikace a úloha v invazivitě nádorových buněk

Citovat

BOUCHAL, Pavel; Jakub FAKTOR; Josef MARYÁŠ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Vendula PERNIKÁŘOVÁ; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. Proteomické přístupy ve vyhledávání biomarkerů a molekulární klasifikaci nádorů prsu. In XXI. Biologické dny, Brno, 4.-5.9.2014. 2014. ISBN 978-80-260-6793-1.

@misc{1351753,
   author = {Bouchal, Pavel and Faktor, Jakub and Maryáš, Josef and Dvořáková, Monika and Struhárová, Iva and Pernikářová, Vendula and Vojtěšek, Bořivoj and Nenutil, Rudolf},
   booktitle = {XXI. Biologické dny, Brno, 4.-5.9.2014},
   language = {cze},
   isbn = {978-80-260-6793-1},
   title = {Proteomické přístupy ve vyhledávání biomarkerů a molekulární klasifikaci nádorů prsu},
   year = {2014}
}

TY  - SLIDE
ID  - 1351753
AU  - Bouchal, Pavel - Faktor, Jakub - Maryáš, Josef - Dvořáková, Monika - Struhárová, Iva - Pernikářová, Vendula - Vojtěšek, Bořivoj - Nenutil, Rudolf
PY  - 2014
TI  - Proteomické přístupy ve vyhledávání biomarkerů a molekulární klasifikaci nádorů prsu
SN  - 9788026067931
N2  - Nádory prsu jsou nejčastějším typem nádoru u žen. Současné diagnostické přístupy však stále vykazují nedokonalosti při určení rizika metastazování u skupiny luminal A, kdy malá část pacientek vykazuje v rozporu s teoretickou prognózou časné uzlinové metastáze. V našem projektu se snažíme identifikovat, validovat a charakterizovat specifické proteiny, mechanismy a metastatické molekulární portréty, které by byly použitelné v identifikaci pacientek s vyšším rizikem metastazování, a to na bázi proteomiky. V první fázi projektu jsme se zaměřili na vyhledávání prometastatických cílů v souboru 96 charakterizovaných nádorů prsu zahrnujícího stratifikaci vzorků podle grade, exprese hormonálních receptorů a stavu lymfatických uzlin. Primární proteomická studie byla založena na metodice zahrnující štěpení komplexních lyzátů trypsinem, značení peptidů isobarickými značkami (iTRAQ), separaci peptidů dvourozměrnou kapalinovou chromatografií a identifikaci a kvantifikaci proteinů na bázi vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS). Soubor 95 vybraných genů pak byl profilován na transkriptové úrovni. Statistika zahrnující Spearmanovu korelaci odhalila dva klastry související se stavem lymfatických uzlin u low garde karcinomů. Sada proteinů, změny jejichž exprese byly potvrzeny na proteinové i transkriptové úrovni, byla dále validována pomocí imunohistochemie. V další fázi výzkumného programu se zaměřujeme na klinickou validaci a funkční charakterizaci identifikovaných proteinů zejména ve vztahu k buněčné migraci a invazivitě a studium prometastatických mechanismů na molekulární úrovni. V rámci přednášky bude rovněž poskytnut přehled o nejnovějších proteomických metodách využitelných v dané oblasti výzkumu. Naše výsledky potvrzují, že molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu zahrnují aktivaci proteolýzy, NF-κB dráhy, změny v cytoskeletálních a adhezních proteinech a liší se od mechanismů známých u high-grade karcinomů. Práce je podporována projektem GAČR č. 14-19250S a Evropským fondem pro regionální rozvoj a státním rozpočtem České republiky (RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101).
ER  -

BOUCHAL, Pavel; Jakub FAKTOR; Josef MARYÁŠ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Vendula PERNIKÁŘOVÁ; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. Proteomické přístupy ve vyhledávání biomarkerů a molekulární klasifikaci nádorů prsu. In \textit{XXI. Biologické dny, Brno, 4.-5.9.2014}. 2014. ISBN~978-80-260-6793-1.

Přehled o publikaci