The 9aaTAD Transactivation Domains: From Gal4 to p53

J 2016

The 9aaTAD Transactivation Domains: From Gal4 to p53

PISKÁČEK, Martin; Marek HAVELKA; Martina ŘEZÁČOVÁ a Andrea KNIGHT

Základní údaje

Originální název

The 9aaTAD Transactivation Domains: From Gal4 to p53

Autoři

PISKÁČEK, Martin; Marek HAVELKA; Martina ŘEZÁČOVÁ a Andrea KNIGHT

Vydání

Plos one, San Francisco, Public Library of Science, 2016, 1932-6203

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.806

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/16:00088891

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION DOMAINS; CREB-BINDING PROTEIN; KIX DOMAIN; SACCHAROMYCES-CEREVISIAE; STRUCTURAL BASIS; IN-VITRO; COACTIVATOR; YEAST; CBP; MEDIATOR

Štítky

EL OK

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 4. 1. 2017 15:17, Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková

Anotace

V originále

The family of the Nine amino acid Transactivation Domain, 9aaTAD family, comprises currently over 40 members. The 9aaTAD domains are universally recognized by the transcriptional machinery from yeast to man. We had identified the 9aaTAD domains in the p53, Msn2, Pdr1 and B42 activators by our prediction algorithm. In this study, their competence to activate transcription as small peptides was proven. Not surprisingly, we elicited immense 9aaTAD divergence in hundreds of identified orthologs and numerous examples of the 9aaTAD species' convergence. We found unforeseen similarity of the mammalian p53 with yeast Gal4 9aaTAD domains. Furthermore, we identified artificial 9aaTAD domains generated accidentally by others. From an evolutionary perspective, the observed easiness to generate 9aaTAD transactivation domains indicates the natural advantage for spontaneous generation of transcription factors from DNA binding precursors.

Návaznosti

NT14310, projekt VaV

Název: Buněčné stárnutí u hematoonkologických onemocnění

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Buněčné stárnutí u hematoonkologických onemocnění

NV15-32935A, projekt VaV

Název: Analýza gamma-delta T lymfocytů reaktivních na nádorové buňky u pacientů s B-buněčnou chronickou lymfocytární leukémií: nový přístup k buněčné terapii

Citovat

PISKÁČEK, Martin; Marek HAVELKA; Martina ŘEZÁČOVÁ a Andrea KNIGHT. The 9aaTAD Transactivation Domains: From Gal4 to p53. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2016, roč. 11, č. 9, s. 1-16. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0162842.

@article{1356690,
   author = {Piskáček, Martin and Havelka, Marek and Řezáčová, Martina and Knight, Andrea},
   article_location = {San Francisco},
   article_number = {9},
   doi = {https://doi.org/10.1371/journal.pone.0162842},
   keywords = {TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION DOMAINS; CREB-BINDING PROTEIN; KIX DOMAIN; SACCHAROMYCES-CEREVISIAE; STRUCTURAL BASIS; IN-VITRO; COACTIVATOR; YEAST; CBP; MEDIATOR},
   language = {eng},
   issn = {1932-6203},
   journal = {Plos one},
   title = {The 9aaTAD Transactivation Domains: From Gal4 to p53},
   volume = {11},
   year = {2016}
}

TY  - JOUR
ID  - 1356690
AU  - Piskáček, Martin - Havelka, Marek - Řezáčová, Martina - Knight, Andrea
PY  - 2016
TI  - The 9aaTAD Transactivation Domains: From Gal4 to p53
JF  - Plos one
VL  - 11
IS  - 9
SP  - 1-16
EP  - 1-16
PB  - Public Library of Science
SN  - 19326203
KW  - TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION DOMAINS
KW  - CREB-BINDING PROTEIN
KW  - KIX DOMAIN
KW  - SACCHAROMYCES-CEREVISIAE
KW  - STRUCTURAL BASIS
KW  - IN-VITRO
KW  - COACTIVATOR
KW  - YEAST
KW  - CBP
KW  - MEDIATOR
N2  - The family of the Nine amino acid Transactivation Domain, 9aaTAD family, comprises currently over 40 members. The 9aaTAD domains are universally recognized by the transcriptional machinery from yeast to man. We had identified the 9aaTAD domains in the p53, Msn2, Pdr1 and B42 activators by our prediction algorithm. In this study, their competence to activate transcription as small peptides was proven. Not surprisingly, we elicited immense 9aaTAD divergence in hundreds of identified orthologs and numerous examples of the 9aaTAD species' convergence. We found unforeseen similarity of the mammalian p53 with yeast Gal4 9aaTAD domains. Furthermore, we identified artificial 9aaTAD domains generated accidentally by others. From an evolutionary perspective, the observed easiness to generate 9aaTAD transactivation domains indicates the natural advantage for spontaneous generation of transcription factors from DNA binding precursors.
ER  -

PISKÁČEK, Martin; Marek HAVELKA; Martina ŘEZÁČOVÁ a Andrea KNIGHT. The 9aaTAD Transactivation Domains: From Gal4 to p53. \textit{Plos one}. San Francisco: Public Library of Science, 2016, roč.~11, č.~9, s.~1-16. ISSN~1932-6203. Dostupné z: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0162842.

Přehled o publikaci