ULMAN, Vladimír, David SVOBODA, Matti NYKTER, Michal KOZUBEK a Pekka RUUSUVUORI. Virtual cell imaging: A review on simulation methods employed in image cytometry. Cytometry Part A, John Wiley & Sons, 2016, roč. 89A, č. 12, s. 1057-1072. ISSN 1552-4922. doi:10.1002/cyto.a.23031.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Virtual cell imaging: A review on simulation methods employed in image cytometry
Autoři ULMAN, Vladimír (203 Česká republika, domácí), David SVOBODA (203 Česká republika, domácí), Matti NYKTER (246 Finsko), Michal KOZUBEK (203 Česká republika, garant, domácí) a Pekka RUUSUVUORI (246 Finsko).
Vydání Cytometry Part A, John Wiley & Sons, 2016, 1552-4922.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
Stát vydavatele Spojené státy americké
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.222
Kód RIV RIV/00216224:14330/16:00088328
Organizační jednotka Fakulta informatiky
Doi http://dx.doi.org/10.1002/cyto.a.23031
UT WoS 000392724500004
Klíčová slova anglicky cell imaging; virtual imaging; simulation; digital cell; cell model; digital phantom; ground truth; validation; image cytometry
Štítky CBIA, cbia-web
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 27. 4. 2017 06:57.
Anotace
The simulations of cells and microscope images thereof have been used to facilitate the development, selection, and validation of image analysis algorithms employed in cytometry as well as for modeling and understanding cell structure and dynamics beyond what is visible in the eyepiece. The simulation approaches vary from simple parametric models of specific cell components—especially shapes of cells and cell nuclei—to learning-based synthesis and multi-stage simulation models for complex scenes that simultaneously visualize multiple object types and incorporate various properties of the imaged objects and laws of image formation. This review covers advances in artificial digital cell generation at scales ranging from particles up to tissue synthesis and microscope image simulation methods, provides examples of the use of simulated images for various purposes ranging from subcellular object detection to cell tracking, and discusses how such simulators have been validated. Finally, the future possibilities and limitations of simulation-based validation are considered.
Návaznosti
GBP302/12/G157, projekt VaVNázev: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu a při diferenciaci v normě a patologii
Investor: Grantová agentura ČR, Projekty na podporu excelence v základním výzkumu
VytisknoutZobrazeno: 12. 12. 2019 14:34