NODZYNSKI, Tomasz, Steffen VANNESTE, Marta ZWIEWKA, Markéta PERNISOVÁ, Jan HEJÁTKO a Jiří FRIML. Enquiry into the Topology of Plasma Membrane-Localized PIN Auxin Transport Components. Molecular Plant. CAMBRIDGE: Cell Press, 2016, roč. 9, č. 11, s. 1504-1519. ISSN 1674-2052. doi:10.1016/j.molp.2016.08.010.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Enquiry into the Topology of Plasma Membrane-Localized PIN Auxin Transport Components
Autoři NODZYNSKI, Tomasz (616 Polsko, garant, domácí), Steffen VANNESTE (56 Belgie), Marta ZWIEWKA (616 Polsko, domácí), Markéta PERNISOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jan HEJÁTKO (203 Česká republika, domácí) a Jiří FRIML (203 Česká republika).
Vydání Molecular Plant, CAMBRIDGE, Cell Press, 2016, 1674-2052.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 8.827
Kód RIV RIV/00216224:14740/16:00088530
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2016.08.010
UT WoS 000389594100008
Klíčová slova anglicky plasma membrane protein; topology; auxin efflux carriers; Arabidopsis thaliana
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Markéta Pernisová, Ph.D., učo 11554. Změněno: 15. 3. 2018 22:42.
Anotace
Auxin directs plant ontogenesis via differential accumulation within tissues depending largely on the activity of PIN proteins that mediate auxin efflux from cells and its directional cell-to-cell transport. Regardless of the developmental importance of PINs, the structure of these transporters is poorly characterized. Here, we present experimental data concerning protein topology of plasma membrane-localized PINs. Utilizing approaches based on pH-dependent quenching of fluorescent reporters combined with immunolocalization techniques,we mapped the membrane topology of PINs and further cross-validated our results using available topology modeling software. We delineated the topology of PIN1 with two transmembrane (TM) bundles of five a-helices linked by a large intracellular loop and a C-terminus positioned outside the cytoplasm. Using constraints derived from our experimental data, we also provide an updated position of helical regions generating a verisimilitude model of PIN1. Since the canonical long PINs show a high degree of conservation in TM domains and auxin transport capacity has been demonstrated for Arabidopsis representatives of this group, this empirically enhanced topological model of PIN1 will be an important starting point for further studies on PIN structure-function relationships. In addition, we have established protocols that can be used to probe the topology of other plasma membrane proteins in plants.
Návaznosti
GA13-39982S, projekt VaVNázev: Molekulární mechanismy auxín-cytokinínové interakce v regulaci rostlinné organogenese.
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
GA13-40637S, projekt VaVNázev: Genetické studie k identifikaci molekulárních mechanizmů buněčné polarity a auxinového transportu v rostlinách
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní program udržitelnosti II (LQ)
VytisknoutZobrazeno: 19. 4. 2021 20:52