GETTOVÁ, Lenka a Andrea VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ. De-novo development of microsatellite markers for Dactylogyrus vistulae. In 5th Workshop of the European Centre of IchtyoParasitology. 2016. ISBN 978-80-210-8373-8.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název De-novo development of microsatellite markers for Dactylogyrus vistulae
Autoři GETTOVÁ, Lenka (703 Slovensko, domácí) a Andrea VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání 5th Workshop of the European Centre of IchtyoParasitology, 2016.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/16:00088713
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 978-80-210-8373-8
Klíčová slova anglicky Monogenea; Dactylogyrus; microsatellites
Změnil Změnila: Mgr. Lenka Gettová, učo 395842. Změněno: 27. 2. 2017 12:04.
Anotace
In our study, we aimed to characterize de-novo microsatellite markers for Dactylogyrus parasites. Dactylogyrus vistulae was selected as a model organism owing to its relatively large body size in comparison to the other members of this genus. Approximately 300 specimens of D. vistulae were collected from European chub Squalius cephalus of the Dyje River. Genomic DNA was isolated and subsequently prepared genomic libraries were subjected to Illumina MiSeq (provided by CEITEC, MU, Brno). QDD program (Meglécz et al. 2010) was used for selecting microsatellite markers and primer design. Following criteria used in Gettová et al. (2013) 70 sequences with target microsatellites were selected. Monogenean parasites, especially dactylogyrids, display a high level of host specificity. As a result genetic structure of monogenean parasites might be host-dependent. Microsatellite markers developed for Dactylogyrus parasites might, therefore, enable us to reconstruct the evolution history of their fish hosts. In addition, in the case of rare generalist Dactylogyrus parasites (such is D. vistulae), we expect that the microsatellites will represent a useful tool to analyse the structure of parasite populations parasitizing different host species and/or geographically isolated parasite populations across Europe.
Návaznosti
GAP505/12/0375, projekt VaVNázev: Evolučně-imunitní a ekologické aspekty parazitace u hybridních a polyploidních kaprovitých ryb
Investor: Grantová agentura ČR, Evolučně-imunitní a ekologické aspekty parazitace u hybridních a polypoidních kaprovitých ryb
VytisknoutZobrazeno: 19. 9. 2024 06:16