2017
Quo Vadis, Biomacromolecular Structure Quality
SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka; Vladimír HORSKÝ; David SEHNAL; Veronika BENDOVÁ; Lukáš PRAVDA et. al.Základní údaje
Originální název
Quo Vadis, Biomacromolecular Structure Quality
Autoři
SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka; Vladimír HORSKÝ; David SEHNAL; Veronika BENDOVÁ; Lukáš PRAVDA a Jaroslav KOČA
Vydání
Biophysical Society 61st Annual Meeting, New Orleans, Louisiana, 2017
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISSN
UT WoS
000402375600712
Klíčová slova anglicky
ValTrendsDB; ValidatorDB; biomacromolecule structure quality; ligand quality; X-ray crystallography; Protein Data Bank; Validation Report; trends; interval analysis; Spearman coefficient
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 30. 6. 2020 11:22, Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS.
Anotace
V originále
Missing answers to key questions of biomacromolecular complex structure quality motivated us to focus on an analysis of the current state of data quality and validation trends. Among others, we paid a special attention to ligand validation criteria as they are the most sensitive and interesting part of validation outputs. Our research has been based on validation data from our validation database ValidatorDB (http://ncbr.muni.cz/ValidatorDB) and PDB validation reports. Furthermore, we have compiled all these validation information into the ValTrendsDB dataabse. While certain discovered trends are very positive (e.g., clashscore markedly decreases with the year of structure publication), others are alarming (e.g., ligand quality stagnates with the year of structure publication).
Návaznosti
MUNI/A/1194/2016, interní kód MU |
|