BOČÁNEK, Ondřej, Ondrej ŠEDO, Stanislav PEKÁR a Zbyněk ZDRÁHAL. Evaluation of sample preparation protocols for spider venom profiling by MALDI-TOF MS. Toxicon. Oxford, England: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, roč. 133, July, s. 18-25. ISSN 0041-0101. doi:10.1016/j.toxicon.2017.04.008. 2017.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Evaluation of sample preparation protocols for spider venom profiling by MALDI-TOF MS
Autoři BOČÁNEK, Ondřej (203 Česká republika, domácí), Ondrej ŠEDO (203 Česká republika, domácí), Stanislav PEKÁR (703 Slovensko, garant, domácí) a Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, domácí).
Vydání Toxicon, Oxford, England, PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, 2017, 0041-0101.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 2.352
Kód RIV RIV/00216224:14310/17:00094825
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.toxicon.2017.04.008
UT WoS 000403864000003
Klíčová slova anglicky Venom mass fingerprinting; Spider venom; MALDI-TOF MS
Štítky CF PROT, NZ, rivok
Změnil Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 3. 4. 2018 14:56.
Anotace
Spider venoms are highly complex mixtures containing biologically active substances with potential for use in biotechnology or pharmacology. Fingerprinting of venoms by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) is a thriving technology, enabling the rapid detection of peptide/protein components that can provide comparative information. In this study, we evaluated the effects of sample preparation procedures on MALDI-TOF mass spectral quality to establish a protocol providing the most reliable analytical outputs. We adopted initial sample preparation conditions from studies already published in this field. Three different MALDI matrixes, three matrix solvents, two sample deposition methods, and different acid concentrations were tested. As a model sample, venom from Brachypelma albopilosa was used. The mass spectra were evaluated on the basis of absolute and relative signal intensities, and signal resolution. By conducting three series of analyses at three weekly intervals, the reproducibility of the mass spectra were assessed as a crucial factor in the selection for optimum conditions. A sample preparation protocol based on the use of an HCCA matrix dissolved in 50% acetonitrile with 2.5% TFA deposited onto the target by the dried-droplet method was found to provide the best results in terms of information yield and repeatability. We propose that this protocol should be followed as a standard procedure, enabling the comparative assessment of MALDI-TOF MS spider venom fingerprints.
Návaznosti
GA15-14762S, projekt VaVNázev: Koevoluce potravní-specializace a složení jedu u pavouků
Investor: Grantová agentura ČR, Koevoluce potravní-specializace a složení jedu u pavouků
LM2015043, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
VytisknoutZobrazeno: 20. 4. 2024 03:02