2017
Candidate gene molecular markers as tools for analyzing genetic susceptibility to Morbillivirus infection in stranded Cetaceans
STEJSKALOVA, Karla, Zuzana BAYEROVÁ, Ján FUTAS, Kristýna HRAZDILOVÁ, Marie KLUMPLEROVÁ et. al.Základní údaje
Originální název
Candidate gene molecular markers as tools for analyzing genetic susceptibility to Morbillivirus infection in stranded Cetaceans
Autoři
STEJSKALOVA, Karla (203 Česká republika), Zuzana BAYEROVÁ (203 Česká republika), Ján FUTAS (703 Slovensko), Kristýna HRAZDILOVÁ (203 Česká republika), Marie KLUMPLEROVÁ (203 Česká republika), Jan OPPELT (203 Česká republika, garant, domácí), Petra SPLICHALOVA (203 Česká republika), Giovanni Di GUARDO (380 Itálie), Sandro MAZZARIOL (380 Itálie), Cristina Esmeralda Di FRANCESCO (380 Itálie), Gabriella Di FRANCESCO (380 Itálie), Giuliana TERRACCIANO (380 Itálie), Romulus-Marian PAIU (380 Itálie), Teodor Dan URSACHE (380 Itálie), David MODRY (203 Česká republika) a Petr HOŘÍN (203 Česká republika)
Vydání
HLA, 2017, 2059-2302
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10601 Cell biology
Stát vydavatele
Spojené státy
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 2.558
Kód RIV
RIV/00216224:14740/17:00097652
Organizační jednotka
Středoevropský technologický institut
UT WoS
000415933600003
Klíčová slova anglicky
Cetacea; Immunity; innate; Haplotype; MHC-DQB; Phocoena phocoena; Polymorphism; single nucleotide; Stenella coeruleoalba
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 17. 5. 2018 14:05, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.
Anotace
V originále
Morbilliviruses, such as Cetacean morbillivirus (CeMV) or Phocine distemper virus (PDV), represent a growing threat for marine mammals on both hemispheres. Since free-ranging animal populations strongly rely on natural resistance mechanisms, innate immunity related genes and virus cell entry receptor genes may represent key factors involved in susceptibility to CeMV in Cetaceans. Using the next generation sequencing technology, we have sequenced eleven candidate genes in two model species, Stenella coeruleoalba and Phocoena phocoena. Suitable single nucleotide polymorphism markers of potential functional importance, located in genes coding for basigin (BSG, CD147), the signaling lymphocyte activating molecule (SLAMF1), the poliovirus related receptor-4 (NECTIN4, PVRL4), toll-like receptors 3,7,8 (TLR3, TLR7, TLR8), natural resistance-associated macrophage protein (SLC11A1) and natural cytotoxicity triggering receptor 1 (NCR1), were identified in each model species, along with MHC-DQB haplotypes unique for each species. This set of molecular markers represents a potentially useful tool for studying host genetic variation and susceptibility to Morbillivirus infection in Cetaceans as well as for studying functionally important genetic diversity of selected Cetacean populations.