Tigray virus - nově popsaný hantavirus u etiopského hlodavce
Stenocephalemys albipes

k 2017

Tigray virus - nově popsaný hantavirus u etiopského hlodavce Stenocephalemys albipes

TĚŠÍKOVÁ, Jana; Yonas MEHERETU; Dagmar ČÍŽKOVÁ; Anna BRYJOVÁ; Josef BRYJA et al.

Základní údaje

Originální název

Tigray virus - nově popsaný hantavirus u etiopského hlodavce Stenocephalemys albipes

Autoři

TĚŠÍKOVÁ, Jana; Yonas MEHERETU; Dagmar ČÍŽKOVÁ; Anna BRYJOVÁ; Josef BRYJA a Joëlle GOÜY DE BELLOCQ

Vydání

Zoologické dny Brno 2017 : Sborník abstraktů z konference 9.-10. února 2017, 2017

Další údaje

Typ výsledku

Prezentace na konferencích

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

ISBN

978-80-87189-21-4

Změněno: 25. 9. 2017 12:08, Mgr. Jana Těšíková, Ph.D.

Anotace

V originále

Hantaviry jsou obalené jednořetězcové RNA viry patřící do čeledi Bunyaviridae. Jejich přirození hostitelé jsou hlodavci, letouni a hmyzožravci. Někteří zástupci jsou významnými patogeny člověka a způsobují řadu závažných zdravotních problémů. V průběhu předešlé studie jsme ve tkáních etiopského endemického hlodavce Stenocephalemys albipes detekovali vůbec první východoafrický hantavirus, virus Tigray (TIGV) (Meheretu et al. 2012). Metodou sekvenování nové generace (NGS, next-generation sequencing) jsme získali kompletní genom tohoto viru, který vykazuje typickou organizaci segmentovaného genomu hantavirů. Fylogenetická analýza kódujících částí genomu potvrdila umístění TIGV do skupiny III (sensu Guo et al. 2013), avšak s rozdílnou pozicí pro jednotlivé segmenty. Naším následujícím cílem bylo popsat fylogeografickou strukturu TIGV v Etiopii. Předběžné výsledky, založené na částečné sekvenci L segmentu, ukazují korelaci mezi prostorovou strukturou TIGV a fylogeografií jeho hostitele. Dalším krokem bude potvrzení tohoto závěru také pro ostatní virové segmenty.

Citovat

TĚŠÍKOVÁ, Jana; Yonas MEHERETU; Dagmar ČÍŽKOVÁ; Anna BRYJOVÁ; Josef BRYJA a Joëlle GOÜY DE BELLOCQ. Tigray virus - nově popsaný hantavirus u etiopského hlodavce Stenocephalemys albipes. In Zoologické dny Brno 2017 : Sborník abstraktů z konference 9.-10. února 2017. 2017. ISBN 978-80-87189-21-4.

@proceedings{1390688,
   author = {Těšíková, Jana and Meheretu, Yonas and Čížková, Dagmar and Bryjová, Anna and Bryja, Josef and Goüy de Bellocq, Joëlle},
   booktitle = {Zoologické dny Brno 2017 : Sborník abstraktů z konference 9.-10. února 2017},
   isbn = {978-80-87189-21-4},
   title = {Tigray virus - nově popsaný hantavirus u etiopského hlodavce Stenocephalemys albipes},
   year = {2017}
}

TY  - CONF
ID  - 1390688
AU  - Těšíková, Jana - Meheretu, Yonas - Čížková, Dagmar - Bryjová, Anna - Bryja, Josef - Goüy de Bellocq, Joëlle
PY  - 2017
TI  - Tigray virus - nově popsaný hantavirus u etiopského hlodavce Stenocephalemys albipes
SN  - 9788087189214
N2  - Hantaviry jsou obalené jednořetězcové RNA viry patřící do čeledi Bunyaviridae. Jejich přirození hostitelé jsou hlodavci, letouni a hmyzožravci. Někteří zástupci jsou významnými patogeny člověka a způsobují řadu závažných zdravotních problémů. V průběhu předešlé studie jsme ve tkáních etiopského endemického hlodavce Stenocephalemys albipes detekovali vůbec první východoafrický hantavirus, virus Tigray (TIGV) (Meheretu et al. 2012). Metodou sekvenování nové generace (NGS, next-generation sequencing) jsme získali kompletní genom tohoto viru, který vykazuje typickou organizaci segmentovaného genomu hantavirů. Fylogenetická analýza kódujících částí genomu potvrdila umístění TIGV do skupiny III (sensu Guo et al. 2013), avšak s rozdílnou pozicí pro jednotlivé segmenty. Naším následujícím cílem bylo popsat fylogeografickou strukturu TIGV v Etiopii. Předběžné výsledky, založené na částečné sekvenci L segmentu, ukazují korelaci mezi prostorovou strukturou TIGV a fylogeografií jeho hostitele. Dalším krokem bude potvrzení tohoto závěru také pro ostatní virové segmenty.
ER  -

TĚŠÍKOVÁ, Jana; Yonas MEHERETU; Dagmar ČÍŽKOVÁ; Anna BRYJOVÁ; Josef BRYJA a Jo$\backslash$''elle GOÜY DE BELLOCQ. Tigray virus - nově popsaný hantavirus u etiopského hlodavce Stenocephalemys albipes. In \textit{Zoologické dny Brno 2017 : Sborník abstraktů z konference 9.-10. února 2017}. 2017. ISBN~978-80-87189-21-4.

Přehled o publikaci