Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete
Genome Sequence and Metabolic Profiling

J 2017

Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling

SNOPKOVÁ, Kateřina; Karel SEDLÁŘ; Juraj BOSÁK; Eva CHALOUPKOVÁ; Ivo SEDLÁČEK et al.

Základní údaje

Originální název

Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling

Autoři

SNOPKOVÁ, Kateřina; Karel SEDLÁŘ; Juraj BOSÁK; Eva CHALOUPKOVÁ; Ivo SEDLÁČEK; Ivo PROVAZNÍK a David ŠMAJS

Vydání

Evolutionary Bioinformatics, London, Sage Publications LTD, 2017, 1176-9343

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10602 Biology , Evolutionary biology

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 1.877

Kód RIV

RIV/00216224:14110/17:00095198

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

https://doi.org/10.1177/1176934317700863

UT WoS

000397968000001

EID Scopus

2-s2.0-85035143879

Klíčová slova anglicky

Pragia fontium; Enterobacteriaceae; whole genome sequence; phylogeny; free-living bacteria

Štítky

EL OK, podil

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 18. 3. 2018 15:29, Soňa Böhmová

Anotace

V originále

Whole genome sequencing and metabolic fingerprinting confirmed the phylogenetic position of P. fontium inside the group of atypical H2S producers. Genomic data have revealed that P- fontium 24613 has limited pathogenic potential, although there are signs of genome decay. Although the lack of specific virulence factors and no association with a host species suggest a free-living style, the signs of genome decay suggest a proces of adaptation to an as-yet-unknown host.

Návaznosti

GA16-21649S, projekt VaV

Název: Molekulární charakterizace nových bakteriocinů identifikovaných v rodech Escherichia a Shigella

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární charakterizace nových bakteriocinů identifikovaných v rodech Escherichia a Shigella

MUNI/11/InGA04/2014, interní kód MU

Název: Alternativní antimikrobiální látky: studium vazby kolicinů na povrch patogenní bakterie

Investor: Masarykova univerzita, Alternativní antimikrobiální látky: studium vazby kolicinů na povrch patogenní bakterie

Citovat

SNOPKOVÁ, Kateřina; Karel SEDLÁŘ; Juraj BOSÁK; Eva CHALOUPKOVÁ; Ivo SEDLÁČEK; Ivo PROVAZNÍK a David ŠMAJS. Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling. Evolutionary Bioinformatics. London: Sage Publications LTD, 2017, roč. 13, č. 1176934317700863, s. 1-7. ISSN 1176-9343. Dostupné z: https://doi.org/10.1177/1176934317700863.

@article{1396379,
   author = {Snopková, Kateřina and Sedlář, Karel and Bosák, Juraj and Chaloupková, Eva and Sedláček, Ivo and Provazník, Ivo and Šmajs, David},
   article_location = {London},
   article_number = {1176934317700863},
   doi = {https://doi.org/10.1177/1176934317700863},
   keywords = {Pragia fontium; Enterobacteriaceae; whole genome sequence; phylogeny; free-living bacteria},
   language = {eng},
   issn = {1176-9343},
   journal = {Evolutionary Bioinformatics},
   title = {Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling},
   volume = {13},
   year = {2017}
}

TY  - JOUR
ID  - 1396379
AU  - Snopková, Kateřina - Sedlář, Karel - Bosák, Juraj - Chaloupková, Eva - Sedláček, Ivo - Provazník, Ivo - Šmajs, David
PY  - 2017
TI  - Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling
JF  - Evolutionary Bioinformatics
VL  - 13
IS  - 1176934317700863
SP  - 1-7
EP  - 1-7
PB  - Sage Publications LTD
SN  - 11769343
KW  - Pragia fontium
KW  - Enterobacteriaceae
KW  - whole genome sequence
KW  - phylogeny
KW  - free-living bacteria
N2  - Whole genome sequencing and metabolic fingerprinting confirmed the phylogenetic position of P. fontium inside the group of atypical H2S producers. Genomic data have revealed that P- fontium 24613 has limited pathogenic potential, although there are signs of genome decay. Although the lack of specific virulence factors and no association with a host species suggest a free-living style, the signs of genome decay suggest a proces of adaptation to an as-yet-unknown host.
ER  -

SNOPKOVÁ, Kateřina; Karel SEDLÁŘ; Juraj BOSÁK; Eva CHALOUPKOVÁ; Ivo SEDLÁČEK; Ivo PROVAZNÍK a David ŠMAJS. Free-Living Enterobacterium Pragia fontium 24613: Complete Genome Sequence and Metabolic Profiling. \textit{Evolutionary Bioinformatics}. London: Sage Publications LTD, 2017, roč.~13, č.~1176934317700863, s.~1-7. ISSN~1176-9343. Dostupné z: https://doi.org/10.1177/1176934317700863.

Přehled o publikaci