Využití komparativní proteomiky při studiu adaptace
chemolitotrofních acidofilních bakterií na změny vnějšího
prostředí

a 2017

Využití komparativní proteomiky při studiu adaptace chemolitotrofních acidofilních bakterií na změny vnějšího prostředí

KUČERA, Jiří; Pavel BOUCHAL; Oldřich JANICZEK a Martin MANDL

Základní údaje

Originální název

Využití komparativní proteomiky při studiu adaptace chemolitotrofních acidofilních bakterií na změny vnějšího prostředí

Autoři

KUČERA, Jiří; Pavel BOUCHAL; Oldřich JANICZEK a Martin MANDL

Vydání

5. Neformální proteomické setkání, 2017

Další údaje

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Změněno: 23. 1. 2018 14:40, Mgr. Jiří Kučera, Ph.D.

Anotace

V originále

Chemolitotrofní acidofilní bakterie se přirozeně vyskytují v prostředí s velmi nízkým pH (< 3), jehož součástí jsou nezřídka i toxické kovy o vysoké koncentraci. V těchto extrémních podmínkách si tyto bakterie osvojily substrátovou variabilitu, díky níž jsou schopny získat energii respirací různých anorganických elektronových donorů a akceptorů. Nejdostupnějšími elektronovými donory v extrémně kyselém prostředí jsou redukované sirné látky, železnaté ionty a vodík. Akceptorem elektronů pak může být z bioenergetického hlediska kyslík a železité ionty, u některých bakteriálních kmenů i elementární síra. Efektivní adaptace na změnu dostupnosti elektronového donoru a akceptoru je tak pro tyto bakterie zásadním klíčem k přežití. Při studiu adaptačních procesů a jejich regulace u modelové bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans byly využity různé proteomické přístupy zahrnující dvoudimenzionální elektroforézu s hmotnostní spektrometrií a v poslední době také přímou analýzu proteomu po mocí pokročilé hmotnostní spektrometrie. Dosažené výsledky pomohly odhalit některé buněčné procesy během adaptace na změnu energetických substrátů, ale zejména byly na jejich základech navrhnuty zcela nové respirační dráhy do té doby nezmapované.

Návaznosti

GP14-27075P, projekt VaV

Název: Mechanismus bakteriální anaerobní oxidace síry ovlivňující acidifikaci prostředí sulfidových odpadů

Investor: Grantová agentura ČR, Mechanismus bakteriální anaerobní oxidace síry ovlivňující acidifikaci prostředí sulfidových odpadů

MUNI/A/1278/2016, interní kód MU

Název: Podpora biochemického výzkumu v roce 2017

Investor: Masarykova univerzita, Podpora biochemického výzkumu v roce 2017, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty

Citovat

KUČERA, Jiří; Pavel BOUCHAL; Oldřich JANICZEK a Martin MANDL. Využití komparativní proteomiky při studiu adaptace chemolitotrofních acidofilních bakterií na změny vnějšího prostředí. In 5. Neformální proteomické setkání. 2017.

@proceedings{1404019,
   author = {Kučera, Jiří and Bouchal, Pavel and Janiczek, Oldřich and Mandl, Martin},
   booktitle = {5. Neformální proteomické setkání},
   title = {Využití komparativní proteomiky při studiu adaptace chemolitotrofních acidofilních bakterií na změny vnějšího prostředí},
   year = {2017}
}

TY  - CONF
ID  - 1404019
AU  - Kučera, Jiří - Bouchal, Pavel - Janiczek, Oldřich - Mandl, Martin
PY  - 2017
TI  - Využití komparativní proteomiky při studiu adaptace chemolitotrofních acidofilních bakterií na změny vnějšího prostředí
N2  - Chemolitotrofní acidofilní bakterie se přirozeně vyskytují v prostředí s velmi nízkým pH (< 3), jehož součástí jsou nezřídka i toxické kovy o vysoké koncentraci. V těchto extrémních podmínkách si tyto bakterie osvojily substrátovou variabilitu, díky níž jsou schopny získat energii respirací různých anorganických elektronových donorů a akceptorů. Nejdostupnějšími elektronovými donory v extrémně kyselém prostředí jsou redukované sirné látky, železnaté ionty a vodík. Akceptorem elektronů pak může být z bioenergetického hlediska kyslík a železité ionty, u některých bakteriálních kmenů i elementární síra. Efektivní adaptace na změnu dostupnosti elektronového donoru a akceptoru je tak pro tyto bakterie zásadním klíčem k přežití. Při studiu adaptačních procesů a jejich regulace u modelové bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans byly využity různé proteomické přístupy zahrnující dvoudimenzionální elektroforézu s hmotnostní spektrometrií a v poslední době také přímou analýzu proteomu po mocí pokročilé hmotnostní spektrometrie. Dosažené výsledky pomohly odhalit některé buněčné procesy během adaptace na změnu energetických substrátů, ale zejména byly na jejich základech navrhnuty zcela nové respirační dráhy do té doby nezmapované.
ER  -

Přehled o publikaci