Identification of factors required for m(6)A mRNA methylation in Arabidopsis reveals a role for the conserved E3 ubiquitin ligase HAKAI

RŮŽIČKA, Kamil, M. ZHANG, A. CAMPILHO, Z. BODI, M. KASHIF, Mária SALEH, D. EECKHOUT, S. EL-SHOWK, H.Y. LI, S.L. ZHONG, G. DE JAEGER, N.P. MONGAN, Jan HEJÁTKO, Y. HELARIUTTA a R.G. FRAY. Identification of factors required for m(6)A mRNA methylation in Arabidopsis reveals a role for the conserved E3 ubiquitin ligase HAKAI. New Phytologist. HOBOKEN: WILEY-BLACKWELL, 2017, roč. 215, č. 1, s. 157-172. ISSN 0028-646X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/nph.14586.

Základní údaje

• Originální název: Identification of factors required for m(6)A mRNA methylation in Arabidopsis reveals a role for the conserved E3 ubiquitin ligase HAKAI
• Autoři: RŮŽIČKA, Kamil (203 Česká republika, domácí), M. ZHANG (156 Čína), A. CAMPILHO (620 Portugalsko), Z. BODI (826 Velká Británie a Severní Irsko), M. KASHIF (246 Finsko), Mária SALEH (703 Slovensko, domácí), D. EECKHOUT (56 Belgie), S. EL-SHOWK (246 Finsko), H.Y. LI (826 Velká Británie a Severní Irsko), S.L. ZHONG (826 Velká Británie a Severní Irsko), G. DE JAEGER (56 Belgie), N.P. MONGAN (826 Velká Británie a Severní Irsko), Jan HEJÁTKO (203 Česká republika, garant, domácí), Y. HELARIUTTA (826 Velká Británie a Severní Irsko) a R.G. FRAY (826 Velká Británie a Severní Irsko).
• Vydání: New Phytologist, HOBOKEN, WILEY-BLACKWELL, 2017, 0028-646X.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 10611 Plant sciences, botany
• Stát vydavatele: Spojené státy
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Impakt faktor: Impact factor: 7.433
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/17:00095575
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• Doi: http://dx.doi.org/10.1111/nph.14586
• UT WoS: 000402413100016
• Klíčová slova anglicky: Arabidopsis; HAKAI; mRNA methylation; N6-adenosine methylation (m(6)A); protoxylem; VIRILIZER
• Štítky: CF CELLIM, rivok
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

N6-adenosine methylation (m(6)A) of mRNA is an essential process in most eukaryotes, but its role and the status of factors accompanying this modification are still poorly understood. Using combined methods of genetics, proteomics and RNA biochemistry, we identified a core set of mRNA m(6)A writer proteins in Arabidopsis thaliana. The components required for m(6)A in Arabidopsis included MTA, MTB, FIP37, VIRILIZER and the E3 ubiquitin ligase HAKAI. Downregulation of these proteins led to reduced relative m(6)A levels and shared pleiotropic phenotypes, which included aberrant vascular formation in the root, indicating that correct m(6)A methylation plays a role in developmental decisions during pattern formation. The conservation of these proteins amongst eukaryotes and the demonstration of a role in writing m(6)A for the E3 ubiquitin ligase HAKAI is likely to be of considerable relevance beyond the plant sciences.

Návaznosti

• EE2.3.20.0189, projekt VaV: Název: Rozvoj výzkumné excelence v oblasti evoluční cytogenomiky, epigenetiky a buněčné signalizace
• GAP501/12/0934, projekt VaV: Název: Role sestřihu RNA v buněčném osudu protoxylému

Investor: Grantová agentura ČR, Role sestřihu RNA v buněčném osudu protoxylému

• LM2015062, projekt VaV: Název: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, National research infrastructure for biological and medical imaging

• LM2015091, projekt VaV: Název: Národní centrum lékařské genomiky (Akronym: NCLG)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní centrum lékařské genomiky

• LQ1601, projekt VaV: Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020