R 2016

E-cyanobacterium.org: A Web-based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria

TROJÁK, Matej; David ŠAFRÁNEK; Jakub HRABEC; Jakub ŠALAGOVIČ; Jan ČERVENÝ et al.

Základní údaje

Originální název

E-cyanobacterium.org: A Web-based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria

Název česky

E-cyanobacterium.org: Webová platforma pre modelovanie siníc

Vydání

2016

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Software

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14330/16:00101019

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

systems biology; cyanobacteria; database; annotation

Technické parametry

webová aplikace

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 22. 6. 2018 14:30, RNDr. Matej Troják, Ph.D.

Anotace

V originále

E-cyanobacterium.org is an online platform providing tools for public sharing, annotation, analysis, and visualisation of dynamical models and wet-lab experiments related to cyanobacteria. The platform is unique in integrating abstract mathematical models with a precise consortium-agreed biochemical description provided in a rule-based formalism. The general aim is to stimulate collaboration between experimental and computational systems biologists to achieve a better understanding of cyanobacteria.

Česky

Nástroj poskytuje online platformu pre zdieľanie, anotáciu, analýzu a vizualizáciu dynamických modelov a experimentov týkajúcich sa siníc. Unikátnosť výsledku je v integrovaní matematických modelov s biochemickým popisom pomocou modelovania založeného na pravidlách.

Návaznosti

GA15-11089S, projekt VaV
Název: Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů
Investor: Grantová agentura ČR, Získávání parametrů biologických modelů pomocí techniky ověřování modelů
LM2015055, projekt VaV
Název: Centrum pro systémovou biologii (Akronym: C4SYS)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology