Conformational Selection of Dimethylarginine Recognition by the
Survival Motor Neuron Tudor Domain

J 2018

Conformational Selection of Dimethylarginine Recognition by the Survival Motor Neuron Tudor Domain

SUPEKAR, S.; Anna PAPAGEORGIOU; G. GEMMECKER; R. PELTZER; M.P. JOHANSSON et. al.

Základní údaje

Originální název

Conformational Selection of Dimethylarginine Recognition by the Survival Motor Neuron Tudor Domain

Autoři

SUPEKAR, S. (276 Německo); Anna PAPAGEORGIOU (300 Řecko, domácí); G. GEMMECKER (276 Německo); R. PELTZER (276 Německo); M.P. JOHANSSON (578 Norsko); Konstantinos TRIPSIANES (300 Řecko, garant, domácí); M. SATTLER (276 Německo) a V.R.I. KAILA (276 Německo)

Vydání

Angewandte Chemie International Edition, WEINHEIM (GERMANY), Verlag Chemie, 2018, 1433-7851

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10402 Inorganic and nuclear chemistry

Stát vydavatele

Německo

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 12.257

Kód RIV

RIV/00216224:14740/18:00101121

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

https://doi.org/10.1002/anie.201708233

UT WoS

000419110500018

EID Scopus

2-s2.0-85042112129

Klíčová slova anglicky

arginine rotation; cation-p interactions; dynamic NMR; QM/MM; quantum chemistry

Štítky

rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 18. 3. 2019 12:35, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.

Anotace

V originále

Tudor domains bind to dimethylarginine (DMA) residues, which are post-translational modifications that play a central role in gene regulation in eukaryotic cells. NMR spectroscopy and quantum calculations are combined to demonstrate that DMA recognition by Tudor domains involves conformational selection. The binding mechanism is confirmed by a mutation in the aromatic cage that perturbs the native recognition mode of the ligand. General mechanistic principles are delineated from the combined results, indicating that Tudor domains utilize cation-p interactions to achieve ligand recognition.

Návaznosti

GJ15-22380Y, projekt VaV

Název: Molekulární stavba protein-DNA komplexů zapojených v opravě nukleotidových sestřihů

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární stavba protein-DNA komplexů zapojených v opravě nukleotidových sestřihů

LQ1601, projekt VaV

Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020

Citovat

SUPEKAR, S.; Anna PAPAGEORGIOU; G. GEMMECKER; R. PELTZER; M.P. JOHANSSON; Konstantinos TRIPSIANES; M. SATTLER a V.R.I. KAILA. Conformational Selection of Dimethylarginine Recognition by the Survival Motor Neuron Tudor Domain. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM (GERMANY): Verlag Chemie, 2018, roč. 57, č. 2, s. 486-490. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/anie.201708233.

@article{1430704,
   author = {Supekar, S. and Papageorgiou, Anna and Gemmecker, G. and Peltzer, R. and Johansson, M.P. and Tripsianes, Konstantinos and Sattler, M. and Kaila, V.R.I.},
   article_location = {WEINHEIM (GERMANY)},
   article_number = {2},
   doi = {https://doi.org/10.1002/anie.201708233},
   keywords = {arginine rotation; cation-p interactions; dynamic NMR; QM/MM; quantum chemistry},
   language = {eng},
   issn = {1433-7851},
   journal = {Angewandte Chemie International Edition},
   title = {Conformational Selection of Dimethylarginine Recognition by the Survival Motor Neuron Tudor Domain},
   volume = {57},
   year = {2018}
}

TY  - JOUR
ID  - 1430704
AU  - Supekar, S. - Papageorgiou, Anna - Gemmecker, G. - Peltzer, R. - Johansson, M.P. - Tripsianes, Konstantinos - Sattler, M. - Kaila, V.R.I.
PY  - 2018
TI  - Conformational Selection of Dimethylarginine Recognition by the Survival Motor Neuron Tudor Domain
JF  - Angewandte Chemie International Edition
VL  - 57
IS  - 2
SP  - 486-490
EP  - 486-490
PB  - Verlag Chemie
SN  - 14337851
KW  - arginine rotation
KW  - cation-p interactions
KW  - dynamic NMR
KW  - QM/MM
KW  - quantum chemistry
N2  - Tudor domains bind to dimethylarginine (DMA) residues, which are post-translational modifications that play a central role in gene regulation in eukaryotic cells. NMR spectroscopy and quantum calculations are combined to demonstrate that DMA recognition by Tudor domains involves conformational selection. The binding mechanism is confirmed by a mutation in the aromatic cage that perturbs the native recognition mode of the ligand. General mechanistic principles are delineated from the combined results, indicating that Tudor domains utilize cation-p interactions to achieve ligand recognition.
ER  -

SUPEKAR, S.; Anna PAPAGEORGIOU; G. GEMMECKER; R. PELTZER; M.P. JOHANSSON; Konstantinos TRIPSIANES; M. SATTLER a V.R.I. KAILA. Conformational Selection of Dimethylarginine Recognition by the Survival Motor Neuron Tudor Domain. \textit{Angewandte Chemie International Edition}. WEINHEIM (GERMANY): Verlag Chemie, 2018, roč.~57, č.~2, s.~486-490. ISSN~1433-7851. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/anie.201708233.

Přehled o publikaci