2018
SugarSketcher: Quick and Intuitive Online Glycan Drawing
ALOCCI, Davide, Pavla SUCHÁNKOVÁ, Renaud COSTA, Nicolas HORY, Julien MARIETHOZ et. al.Základní údaje
Originální název
SugarSketcher: Quick and Intuitive Online Glycan Drawing
Autoři
ALOCCI, Davide (380 Itálie), Pavla SUCHÁNKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Renaud COSTA (203 Česká republika), Nicolas HORY (250 Francie), Julien MARIETHOZ (276 Německo), Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí), Philip TOUKACH (756 Švýcarsko) a Frederique LISACEK (756 Švýcarsko)
Vydání
Molecules, Mayer und Muller, 2018, 1420-3049
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele
Švýcarsko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 3.060
Kód RIV
RIV/00216224:14740/18:00105326
Organizační jednotka
Středoevropský technologický institut
UT WoS
000454523000156
Klíčová slova anglicky
carbohydrate; 2D structure; software; SNFG notation
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 25. 4. 2019 11:58, Mgr. Martin Prokop, Ph.D.
Anotace
V originále
SugarSketcher is an intuitive and fast JavaScript interface module for online drawing of glycan structures in the popular Symbol Nomenclature for Glycans (SNFG) notation and exporting them to various commonly used formats encoding carbohydrate sequences (e.g., GlycoCT) or quality images (e.g., svg). It does not require a backend server or any specific browser plugins and can be integrated in any web glycoinformatics project. SugarSketcher allows drawing glycans both for glycobiologists and non-expert users. The quick mode allows a newcomer to build up a glycan structure having only a limited knowledge in carbohydrate chemistry. The normal mode integrates advanced options which enable glycobiologists to tailor complex carbohydrate structures. The source code is freely available on GitHub and glycoinformaticians are encouraged to participate in the development process while users are invited to test a prototype available on the ExPASY web-site and send feedback.