a 2019

High Resolution Melting Assay: a powerful method usable for species differentiation as well as for detection of polymorphisms associated with anthelmintic resistance?

ŠKORPÍKOVÁ, Lucie; Nikol RESLOVÁ; Jana ILGOVÁ; Simona SAJDÁKOVÁ; Jaroslav VADLEJCH et al.

Základní údaje

Originální název

High Resolution Melting Assay: a powerful method usable for species differentiation as well as for detection of polymorphisms associated with anthelmintic resistance?

Název česky

High Resolution Melting Assay: účinná metoda použitelná pro druhovou diferenciaci i pro detekci polymorfismů spojených s anthelmintickou rezistencí?

Autoři

ŠKORPÍKOVÁ, Lucie; Nikol RESLOVÁ; Jana ILGOVÁ; Simona SAJDÁKOVÁ; Jaroslav VADLEJCH a Martin KAŠNÝ

Vydání

JOINT COMBAR –ACSRPC MEETING: Anthelmintic resistance in ruminants:Who cares? 2019

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10613 Zoology

Stát vydavatele

Belgie

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova česky

HRMA, Haemonchus contortus, Ashworthius sidemi, druhová determinace, anthelmintická rezistence

Klíčová slova anglicky

HRMA, Haemonchus contortus, Ashworthius sidemi, species differentiation, anthelmintic resistance

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 25. 11. 2019 11:22, Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS.

Anotace

V originále

High Resolution Melting Assay (HRMA) is post-PCR method which enables to reveal the genetic variation in DNA samples without the necessity of subsequent sequencing. Sequential changes (down to single nucleotide polymorphisms) are detected in amplified sequences according to their disassociation behavior. In our study, we employed a qPCR-HRMA to differentiate two of the pathogenic nematodes of ruminants – Haemonchus contortus and Ashworthius sidemi at the species level. The amplification and subsequent melting assay were specifically targeting the polymorphisms in two fragments of internal transcribed spacer 1 (ITS1) sequence. For the evaluation of melting process, a difference plot representing the most transparent expression of species-specific matrix curves were used. The occurrence of resistance in helminth species against various classes of anthelmintics has been described in a number of publications. It can be the result of a different mechanisms, such as genetic changes in the drug target genes (e.g. point mutations in β-tubulin gene associated with benzimidazole resistance in Haemonchus contortus). These single nucleotide polymorphisms offer a means of detecting the presence of resistance using the HRMA. We show that qPCR-HRMA is rapid and reliable method which can be used not just to assign individual parasites taxa but it has also considerable potential for the detection of sequential changes associated with anthelmintic resistance.

Návaznosti

GA19-17269S, projekt VaV
Název: Proteolýza ve vejcích parazitických červů: úloha v patologii a její regulace (Akronym: Proteolýza vajec červů)
Investor: Grantová agentura ČR, Proteolýza ve vejcích parazitických červů: úloha v patologii a její regulace
LTC19018, projekt VaV
Název: Pilotní strategický plán boje s rezistentními kmeny parazitických červů v českých hospodářských chovech přežvýkavců (Akronym: Rezistence HELM)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Pilotní strategický plán boje s rezistentními kmeny parazitických červů v českých hospodářských chovech přežvýkavců, INTER-COST
MUNI/A/0918/2018, interní kód MU
Název: Studium evolučních a ekologických vztahů a procesů u akvatických bezobratlých živočichů a v hostitelsko-parazitických systémech (Akronym: EvolEcolParaHydro)
Investor: Masarykova univerzita, Studium evolučních a ekologických vztahů a procesů u akvatických bezobratlých živočichů a v hostitelsko-parazitických systémech, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty