2019
Need for novel detection targets in tuberculosis diagnostics of historical specimens - bioinformatic analysis
CHOCHOLOVÁ, Eva, Eva DROZDOVÁ, Dana FIALOVÁ, Kristýna BRZOBOHATÁ, Václav CHOCHOLA et. al.Základní údaje
Originální název
Need for novel detection targets in tuberculosis diagnostics of historical specimens - bioinformatic analysis
Autoři
CHOCHOLOVÁ, Eva (203 Česká republika, garant, domácí), Eva DROZDOVÁ (203 Česká republika, domácí), Dana FIALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Kristýna BRZOBOHATÁ (203 Česká republika, domácí) a Václav CHOCHOLA (203 Česká republika, domácí)
Vydání
6th International Anthropological Congress of Dr. Aleš Hrdlička, 2019
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Kód RIV
RIV/00216224:14310/19:00110709
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISSN
Klíčová slova česky
patogen; starobylá DNA; aDNA; tuberkulóza; MTBC; IS6110
Klíčová slova anglicky
pathogen; ancient DNA; aDNA; tuberculosis; MTBC; IS6110
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 27. 4. 2023 16:41, Mgr. Eva Chocholová
Anotace
V originále
Diagnosis of tuberculosis from historical specimens has been mostly based on detection of IS6110 by PCR and following gel electrophoresis. Even when some authors stressed the possibility that this insertion sequence may have similar counterparts in other microorganisms (e.g. soil bacteria), it continued to be used widely, sometimes without sequencing of the PCR product. This work is aiming at IS6110 and two other sequences that are potential targets for DNA detection of Mycobacteria tuberculosis complex. These three loci are compared by bioinformatic and phylogenetic analysis to assess their usability in ancient DNA studies.
Návaznosti
| MUNI/C/1717/2016, interní kód MU |
|