Microbial Contamination of Ancient Human Dental Calculus
Studied by Scanning Electron Microscopy and Metagenomic
Approach

a 2019

Microbial Contamination of Ancient Human Dental Calculus Studied by Scanning Electron Microscopy and Metagenomic Approach

CHOCHOLOVÁ, Eva; Dana FIALOVÁ; Eva DROZDOVÁ; Radim SKOUPÝ; Kristýna BRZOBOHATÁ et al.

Základní údaje

Originální název

Microbial Contamination of Ancient Human Dental Calculus Studied by Scanning Electron Microscopy and Metagenomic Approach

Autoři

CHOCHOLOVÁ, Eva ; Dana FIALOVÁ; Eva DROZDOVÁ; Radim SKOUPÝ; Kristýna BRZOBOHATÁ; Barbora ZWINSOVÁ ; Petra VÍDEŇSKÁ a Václav CHOCHOLA

Vydání

6th International Anthropological Congress of Dr. Aleš Hrdlička, 2019

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Plný text

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/19:00110713

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISSN

Klíčová slova česky

starobylá DNA; aDNA; SEM; zubní kámen; metagenomika; kontaminace

Klíčová slova anglicky

ancient DNA; aDNA; SEM; dental calculus; metagenomics; contamination

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 18. 9. 2019 13:17, Mgr. Eva Chocholová, Ph.D.

Anotace

V originále

Dental calculus has great potential in the research of oral microbiome in past populations. Alongside the advantages of novel molecular approaches applied on ancient human dental calculus, we encounter the drawbacks as well. One of the main issues is contamination. There is a possibility of detection of microbial contamination by scanning electron microscopy prior to subsequent expensive molecular analysis. Although decontamination is always part of the workflow, the metagenomic analysis points out the residual microbial contamination. This study presents the means of detecting contamination and precautions to be taken for the best prevention of it.

Návaznosti

MUNI/C/1717/2016, interní kód MU

Název: Identifikace bakteriálně přenosných nemocí z historického zubního kamene

Investor: Masarykova univerzita, Identifikace bakteriálně přenosných nemocí z historického zubního kamene, DO R. 2020 - Program rektora

Citovat

CHOCHOLOVÁ, Eva; Dana FIALOVÁ; Eva DROZDOVÁ; Radim SKOUPÝ; Kristýna BRZOBOHATÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ a Václav CHOCHOLA. Microbial Contamination of Ancient Human Dental Calculus Studied by Scanning Electron Microscopy and Metagenomic Approach. In 6th International Anthropological Congress of Dr. Aleš Hrdlička. 2019. ISSN 2336-4777.

@proceedings{1558736,
   author = {Chocholová, Eva and Fialová, Dana and Drozdová, Eva and Skoupý, Radim and Brzobohatá, Kristýna and Zwinsová, Barbora and Vídeňská, Petra and Chochola, Václav},
   booktitle = {6th International Anthropological Congress of Dr. Aleš Hrdlička},
   keywords = {ancient DNA; aDNA; SEM; dental calculus; metagenomics; contamination},
   language = {eng},
   title = {Microbial Contamination of Ancient Human Dental Calculus Studied by Scanning Electron Microscopy and Metagenomic Approach},
   url = {http://www.pojivo.cz/pu/PU-2019-Suppl-2--Humpolec-190830.pdf},
   year = {2019}
}

TY  - CONF
ID  - 1558736
AU  - Chocholová, Eva - Fialová, Dana - Drozdová, Eva - Skoupý, Radim - Brzobohatá, Kristýna - Zwinsová, Barbora - Vídeňská, Petra - Chochola, Václav
PY  - 2019
TI  - Microbial Contamination of Ancient Human Dental Calculus Studied by Scanning Electron Microscopy and Metagenomic Approach
KW  - ancient DNA
KW  - aDNA
KW  - SEM
KW  - dental calculus
KW  - metagenomics
KW  - contamination
UR  - http://www.pojivo.cz/pu/PU-2019-Suppl-2--Humpolec-190830.pdf
L2  - http://www.pojivo.cz/pu/PU-2019-Suppl-2--Humpolec-190830.pdf
N2  - Dental calculus has great potential in the research of oral microbiome in past populations. Alongside the advantages of novel molecular approaches applied on ancient human dental calculus, we encounter the drawbacks as well. One of the main issues is contamination. There is a possibility of detection of microbial contamination by scanning electron microscopy prior to subsequent expensive molecular analysis. Although decontamination is always part of the workflow, the metagenomic analysis points out the residual microbial contamination. This study presents the means of detecting contamination and precautions to be taken for the best prevention of it.
ER  -

CHOCHOLOVÁ, Eva; Dana FIALOVÁ; Eva DROZDOVÁ; Radim SKOUPÝ; Kristýna BRZOBOHATÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ a Václav CHOCHOLA. Microbial Contamination of Ancient Human Dental Calculus Studied by Scanning Electron Microscopy and Metagenomic Approach. In \textit{6th International Anthropological Congress of Dr. Aleš Hrdlička}. 2019. ISSN~2336-4777.

Přehled o publikaci