2019
p53 Binds Preferentially to Non-B DNA Structures Formed by the Pyrimidine-Rich Strands of GAA center dot TTC Trinucleotide Repeats Associated with Friedreich's Ataxia
HELMA, R., P. BAZANTOVA, M. PETR, M. ADAMIK, D. RENCIUK et. al.Základní údaje
Originální název
p53 Binds Preferentially to Non-B DNA Structures Formed by the Pyrimidine-Rich Strands of GAA center dot TTC Trinucleotide Repeats Associated with Friedreich's Ataxia
Autoři
HELMA, R. (203 Česká republika), P. BAZANTOVA (203 Česká republika), M. PETR (203 Česká republika), M. ADAMIK (203 Česká republika), D. RENCIUK (203 Česká republika), V. TICHY (203 Česká republika), A. PASTUCHOVA (203 Česká republika), Z. SOLDANOVA (203 Česká republika), P. PECINKA (203 Česká republika), R.P. BOWATER (826 Velká Británie a Severní Irsko), Miroslav FOJTA (203 Česká republika, garant, domácí) a M. BRAZDOVA (203 Česká republika)
Vydání
Molecules, BASEL, Mayer und Muller, 2019, 1420-3049
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele
Švýcarsko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 3.267
Kód RIV
RIV/00216224:14740/19:00110732
Organizační jednotka
Středoevropský technologický institut
UT WoS
000472631000051
Klíčová slova anglicky
trinucleotide repeat; p53; non-B DNA; DNA hairpin; DNA-protein; frataxin
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 13. 2. 2020 13:23, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.
Anotace
V originále
Expansions of trinucleotide repeats (TNRs) are associated with genetic disorders such as Friedreich's ataxia. The tumor suppressor p53 is a central regulator of cell fate in response to different types of insults. Sequence and structure-selective modes of DNA recognition are among the main attributes of p53 protein. The focus of this work was analysis of the p53 structure-selective recognition of TNRs associated with human neurodegenerative diseases. Here, we studied binding of full length p53 and several deletion variants to TNRs folded into DNA hairpins or loops. We demonstrate that p53 binds to all studied non-B DNA structures, with a preference for non-B DNA structures formed by pyrimidine (Py) rich strands. Using deletion mutants, we determined the C-terminal DNA binding domain of p53 to be crucial for recognition of such non-B DNA structures. We also observed that p53 in vitro prefers binding to the Py-rich strand over the purine (Pu) rich strand in non-B DNA substrates formed by sequence derived from the first intron of the frataxin gene. The binding of p53 to this region was confirmed using chromatin immunoprecipitation in human Friedreich's ataxia fibroblast and adenocarcinoma cells. Altogether these observations provide further evidence that p53 binds to TNRs' non-B DNA structures.
Návaznosti
692068, interní kód MU |
|