DOUBKOVÁ, Martina, Jakub TRIZULJAK, Zuzana VRZALOVÁ, Anna HRAZDIROVÁ, Ivona BLAHÁKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Novel genetic variant of HPS1 gene in Hermansky-Pudlak syndrome with fulminant progression of pulmonary fibrosis: a case report. BMC Pulmonary Medicine. London: Biomed Central LTD, 2019, roč. 19, č. 1, s. 178-183. ISSN 1471-2466. doi:10.1186/s12890-019-0941-4.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Novel genetic variant of HPS1 gene in Hermansky-Pudlak syndrome with fulminant progression of pulmonary fibrosis: a case report
Autoři DOUBKOVÁ, Martina (203 Česká republika, domácí), Jakub TRIZULJAK (703 Slovensko, domácí), Zuzana VRZALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Anna HRAZDIROVÁ (203 Česká republika, domácí), Ivona BLAHÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lenka RADOVÁ (203 Česká republika, domácí), Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Michael DOUBEK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání BMC Pulmonary Medicine, London, Biomed Central LTD, 2019, 1471-2466.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30203 Respiratory systems
Stát vydavatele Velká Británie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.813
Kód RIV RIV/00216224:14740/19:00108528
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1186/s12890-019-0941-4
UT WoS 000490720400003
Klíčová slova anglicky Exome sequencing; Hermansky-Pudlak syndrome; Pulmonary fibrosis
Štítky 14110215, podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2020 08:57.
Anotace
Background Hermansky-Pudlak syndrome (HPS) is an autosomal recessive disorder that is associated with oculocutaneous albinism, bleeding diathesis, granulomatous colitis, and highly penetrant pulmonary fibrosis in some subtypes. Homozygous or compound heterozygous pathological variants in HPS1, HPS3, HPS4, and several other genes lead to clinical manifestation of the disease. Case presentation A 57-year-old female was admitted with congenital oculocutaneous albinism, thrombocytopathy and late-onset accelerated pulmonary fibrosis (first symptoms from age 50 onwards). Chest high-resolution computed tomography identified thickening of peribronchovascular interstitium, bronchiectasis, reticulations, honeycombing, ground glass opacities and lung parenchyma consolidations. HPS was clinically suspected. We performed whole exome sequencing (WES), a form of massive parallel sequencing, of proband-parents trio. Whole exome libraries were processed using KAPA Hyper Prep Kit, SeqCap EZ MedExome Enrichment Kit and HyperCap Bead Kit according to the SeqCap EZ HyperCap Workflow. The paired-end 2 x 75 bp sequencing was performed on the Illumina NextSeq 500 Sequencer (Illumina Inc., USA). Furthermore, obtained variants by WES were evaluated using a virtual panel of genes: HPS1, AP3B1, HPS3, HPS4, HPS5, HPS6, DTNBP1, BLOC1S3, and PLDN. We identified a compound heterozygous genotype in HPS1 gene in the proband. We identified a pathogenic frameshift variant c.1189delC; p.(Gln397Serfs*2), resulting in a premature stop codon. This variant has been previously associated with HPS. Furthermore, we characterized previously undescribed nonsense variant c.1507C > T; p.(Gln503*), resulting in a premature stop codon and mRNA degradation through nonsense-mediated decay. Sanger sequencing validated the presence of both variants and simultaneously confirmed the heterozygous carrier status of parents. Unfortunately, the patient died due to fulminant progression of pulmonary fibrosis 2 months after diagnostics. Conclusions Compound heterozygous mutations in HPS1 in the proband lead to disruption of HPS1 gene and clinical manifestation of HPS with severe pulmonary fibrosis. This case illustrates the need to consider HPS in differential diagnostics of pulmonary fibrosis. Pulmonary fibrosis is a common cause of death in HPS patients. Earlier diagnosis may enable better treatment for these patients.
Návaznosti
LQ1601, projekt VaVNázev: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní program udržitelnosti II (LQ)
MUNI/A/1105/2018, interní kód MUNázev: Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VI (Akronym: VýDiTeHeMA VI)
Investor: Masarykova univerzita, Grantová agentura MU, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
NV16-29447A, projekt VaVNázev: Vyhledávání mutací predisponujících k familiárním hematologickým a onkologickým onemocněním
VytisknoutZobrazeno: 5. 3. 2021 03:19