MOUTELÍKOVÁ, Romana, Pavel SAUER, Monika DVOŘÁKOVÁ HEROLDOVÁ, Veronika HOLÁ a Jana PRODĚLALOVÁ. Emergence of Rare Bovine-Human Reassortant DS-1-Like Rotavirus A Strains with G8P[8] Genotype in Human Patients in the Czech Republic. VIRUSES-BASEL. BASEL: MDPI AG, 2019, roč. 11, č. 11, s. 1-14. ISSN 1999-4915. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/v11111015.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Emergence of Rare Bovine-Human Reassortant DS-1-Like Rotavirus A Strains with G8P[8] Genotype in Human Patients in the Czech Republic
Autoři MOUTELÍKOVÁ, Romana (203 Česká republika, garant), Pavel SAUER (203 Česká republika), Monika DVOŘÁKOVÁ HEROLDOVÁ (203 Česká republika, domácí), Veronika HOLÁ (203 Česká republika, domácí) a Jana PRODĚLALOVÁ (203 Česká republika).
Vydání VIRUSES-BASEL, BASEL, MDPI AG, 2019, 1999-4915.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10607 Virology
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.816
Kód RIV RIV/00216224:14110/19:00108575
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.3390/v11111015
UT WoS 000502292300043
Klíčová slova anglicky rotavirus A; G8; gastroenteritis; bovine-human reassortants; Central Europe
Štítky 14110113, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 11. 5. 2020 10:45.
Anotace
Group A Rotaviruses (RVA) are the leading cause of acute gastroenteritis in children and a major cause of childhood mortality in low-income countries. RVAs are mostly host-specific, but interspecies transmission and reassortment between human and animal RVAs significantly contribute to their genetic diversity. We investigated the VP7 and VP4 genotypes of RVA isolated from 225 stool specimens collected from Czech patients with gastroenteritis during 2016-2019. The most abundant genotypes were G1P[8] (42.7%), G3P[8] (11.1%), G9P[8] (9.8%), G2P[4] (4.4%), G4P[8] (1.3%), G12P[8] (1.3%), and, surprisingly, G8P[8] (9.3%). Sequence analysis of G8P[8] strains revealed the highest nucleotide similarity of all Czech G8 sequences to the G8P[8] rotavirus strains that were isolated in Vietnam in 2014/2015. The whole-genome backbone of the Czech G8 strains was determined with the use of next-generation sequencing as DS-1-like. Phylogenetic analysis of all segments clustered the Czech isolates with RVA strains that were formerly described in Southeast Asia, which had emerged following genetic reassortment between bovine and human RVAs. This is the first time that bovine-human DS-1-like G8P[8] strains were detected at a high rate in human patients in Central Europe. Whether the emergence of this unusual genotype reflects the establishment of a new RVA strain in the population requires the continuous monitoring of rotavirus epidemiology.
Návaznosti
NV16-29937A, projekt VaVNázev: Komplexní analýza humánních rotavirových infekcí v České republice včetně atypických a emergentních kmenů směřující k vývoji nových detekčních metod
VytisknoutZobrazeno: 24. 8. 2024 04:20