J 2019

Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta

MACHÁČKOVÁ, Táňa; Tomáš GROLICH; L. FIALA; Vladimír PROCHÁZKA; M. ŠKROVINA et. al.

Základní údaje

Originální název

Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta

Název anglicky

Utilization of next generation sequencing in analysis of circulating micrornas as predictive biomarkers for patients with locally advanced rectal Carcinoma

Autoři

MACHÁČKOVÁ, Táňa (203 Česká republika, domácí); Tomáš GROLICH (203 Česká republika); L. FIALA; Vladimír PROCHÁZKA (203 Česká republika, domácí); M. ŠKROVINA; Zdeněk KALA (203 Česká republika, domácí) a Ondřej SLABÝ (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Klinická onkologie, Ambit Media a.s. 2019, 0862-495X

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30204 Oncology

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Kód RIV

RIV/00216224:14740/19:00108619

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

EID Scopus

2-s2.0-85065784688

Klíčová slova anglicky

MicroRNAs; Neoplasms; CRC patients

Štítky

Příznaky

Recenzováno
Změněno: 6. 4. 2020 19:09, Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D.

Anotace

V originále

MikroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující RNA podílející se na posttranskripční regulaci genové exprese. Jsou esenciálními regulátory fyziologických procesů, podílejí se na patogenezi mnoha onemocnění a jejich deregulace byla prokázána u řady nádorových onemocnění vč. karcinomu rekta. Cirkulující miRNA přítomné v krevní plazmě by mohly být vhodnými kandidáty na neinvaziní prediktivní biomarkery odpovědi na neoadjuvantní chemoradioterapii u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta. Předkládaná pilotní studie se zabývá využitím sekvenování nové generace k analýze cirkulujících miRNA.

Anglicky

MicroRNAs (miRNA) are short non-coding RNAs involved in post-transcriptional regulation of gene expression. MiRNAs are essential regulators of both physiological processes as of pathogeneses of many diseases, and their dysregulation was observed in many malignancies including rectal cancer. Circulating miRNAs presented in blood plasma could be potential candidates for non-invasive predictive bio markers of the response of patients with locally advanced rectal cancer to chemoradiotherapy. Presented study aims to evaluate the potential of next-generation sequencing in the analysis of circulating miRNAs. Material and methods: MiRNA expression profi les were done using samples of RNA isolated from blood plasma collected during TNM restaging and paired samples collected before initiation of neoadjuvant chemoradiotherapy. Sequencing libraries were prepared using kit which implements universal molecular indices that help to sensitively fi lter bio logical bias during data analysis. Sequencing data were processed by multidimensional bio statistical approaches. Conclusion: We identifi ed specific miRNA profi le enabling to distinguish the patients accordingly to their response to chemoradiotherapy.

Návaznosti

NV16-31765A, projekt VaV
Název: Využití tkáňových/cirkulujících mikroRNA pro predikci léčebné odpovědi a zpřesnění restagingu karcinomu rekta po neoadjuvantní léčbě