JASEŇÁKOVÁ, Zuzana, Vojtěch ZAPLETAL, Petr PADRTA, Milan ZACHRDLA, N. BOLIK-COULON, T. MARQUARDSEN, J.M. TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, F. FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Boosting the resolution of low-field 15N relaxation experiments on intrinsically disordered proteins with triple-resonance NMR. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2020, roč. 74, 2-3, s. 139-145. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-019-00298-6.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Boosting the resolution of low-field 15N relaxation experiments on intrinsically disordered proteins with triple-resonance NMR
Autoři JASEŇÁKOVÁ, Zuzana (703 Slovensko, domácí), Vojtěch ZAPLETAL (203 Česká republika, domácí), Petr PADRTA (203 Česká republika, domácí), Milan ZACHRDLA (203 Česká republika), N. BOLIK-COULON, T. MARQUARDSEN, J.M. TYBURN, Lukáš ŽÍDEK (203 Česká republika, domácí), F. FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Journal of biomolecular NMR, Dordrecht, Springer, 2020, 0925-2738.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Nizozemské království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.835
Kód RIV RIV/00216224:14740/20:00114136
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1007/s10858-019-00298-6
UT WoS 000520461300004
Klíčová slova anglicky Nuclear magnetic resonance; Relaxation; Dynamics; Intrinsically disordered proteins; High-resolution relaxometry; Non-uniform sampling
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2021 12:12.
Anotace
Improving our understanding of nanosecond motions in disordered proteins requires the enhanced sampling of the spectral density function obtained from relaxation at low magnetic fields. High-resolution relaxometry and two-field NMR measurements of relaxation have, so far, only been based on the recording of one- or two-dimensional spectra, which provide insufficient resolution for challenging disordered proteins. Here, we introduce a 3D-HNCO-based two-field NMR experiment for measurements of protein backbone 15Namide longitudinal relaxation rates. The experiment provides accurate longitudinal relaxation rates at low field (0.33 T in our case) preserving the resolution and sensitivity typical for high-field NMR spectroscopy. Radiofrequency pulses applied on six different radiofrequency channels are used to manipulate the spin system at both fields. The experiment was demonstrated on the C-terminal domain of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis, a protein with highly repetitive amino-acid sequence and very low dispersion of backbone chemical shifts.
Návaznosti
GJ18-04197Y, projekt VaVNázev: Charakterizace flexibilních oblastí RNA polymerázy Bacillus subtilis
Investor: Grantová agentura ČR, Characterization of dynamical regions in RNA polymerase from Bacillus subtilis
VytisknoutZobrazeno: 22. 5. 2024 14:05