J 2020

Molecular insights into the architecture of the human SMC5/6 complex

ADAMUS, Marek; Edit LELKES; David POTĚŠIL; Sri Ranjani GANJI; Peter KOLESÁR et. al.

Základní údaje

Originální název

Molecular insights into the architecture of the human SMC5/6 complex

Název česky

Molekulární vhled do architektury lidského komplexu SMC5/6

Autoři

ADAMUS, Marek (203 Česká republika, domácí); Edit LELKES (703 Slovensko, domácí); David POTĚŠIL (203 Česká republika, domácí); Sri Ranjani GANJI (356 Indie, domácí); Peter KOLESÁR (703 Slovensko, domácí); Kateřina ZÁBRADY ORCID (203 Česká republika, domácí); Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, domácí) a Jan PALEČEK (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Journal of Molecular Biology, London, Academic Press ltd-Elsevier Science ltd, 2020, 0022-2836

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 5.469

Kód RIV

RIV/00216224:14310/20:00114182

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000541931500007

EID Scopus

2-s2.0-85085187710

Klíčová slova anglicky

human SMC5/6 complex architecture; SMC5-SMC6 dimer coiled-coil arms; NSE1-NSE3-NSE4 trimer; NSE5-NSE6 dimer; CANIN protein-protein interaction domain; MAGE domain

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 27. 10. 2024 14:09, Ing. Martina Blahová

Anotace

V originále

A family of Structural Maintenance of Chromosome (SMC) complexes is essential for key cellular processes ensuring proper cohesion, condensation and replication. They share a common SMC-kleisin architecture allowing them to embrace DNA. In SMC5/6, the NSE1 and NSE3 KITE and NSE4 kleisin subunits form a stable subcomplex that binds DNA and regulates essential processes. In addition, NSE5 and NSE6 subunits associate with the core SMC5/6 complex and recruit it to DNA repair sites. The architecture of the SMC5/6 complex is crucial for its proper functioning, and mutations within the human SMC5/6 subunits result in severe syndromes. Therefore, we aimed to analyze interactions within the human SMC5/6 complex and determine its detailed architecture. Firstly, we analyzed different parts of SMC5/6 by crosslinking and MS/MS analysis. Our data suggested domain arrangements of hNSE1-hNSE3 and orientation of hNSE4 within the hNSE1-hNSE3-hNSE4 subcomplex. The crosslinking and electron microscopic analysis of the SMC5/6 core complex showed its rod-like architecture with juxtaposed hSMC5-hSMC6 arms. Additionally, we observed fully or partially opened hSMC5-hSMC6 shapes with the hNSE1-hNSE3-hNSE4 trimer localized in the SMC head domains. To complete mapping of the human SMC5/6 complex architecture, we analyzed positions of hNSE5-hNSE6 at the hSMC5-hSMC6 arms. We showed that hNSE6 binding to hNSE5 and the coiled-coil arm of hSMC6 is mediated by a conserved FAM178 domain, which we therefore renamed CANIN (Coiled-coil SMC6 And NSE5 iNteracting) domain. Interestingly, hNSE6 bound both hSMC5 and hSMC6 arms, suggesting that hNSE6 may lock the arms and regulate the dynamics of the human SMC5/6 complex.

Návaznosti

GA18-02067S, projekt VaV
Název: Úloha Nse1/Nse3/Nse4, E3-ubikvitin ligásy, ve stabilitě genomu
Investor: Grantová agentura ČR, Úloha Nse1/Nse3/Nse4, E3-ubikvitin ligásy, ve stabilitě genomu
LM2018140, projekt VaV
Název: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
LQ1601, projekt VaV
Název: CEITEC 2020 (Akronym: CEITEC2020)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC 2020
90127, velká výzkumná infrastruktura
Název: CIISB II