FÍLA, Jan, Božena KLODOVÁ, David POTĚŠIL, Miloslav JUŘÍČEK, Petr ŠESTÁK, Zbyněk ZDRÁHAL a David HONYS. The Beta Subunit of Nascent Polypeptide Associated Complex Plays A Role in Flowers and Siliques Development of Arabidopsis thaliana. International Journal of Molecular Sciences. Basel: MDPI, 2020, roč. 21, č. 6, s. 1-30. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms21062065.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název The Beta Subunit of Nascent Polypeptide Associated Complex Plays A Role in Flowers and Siliques Development of Arabidopsis thaliana
Autoři FÍLA, Jan (203 Česká republika), Božena KLODOVÁ (203 Česká republika), David POTĚŠIL (203 Česká republika, domácí), Miloslav JUŘÍČEK, Petr ŠESTÁK, Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, garant, domácí) a David HONYS.
Vydání International Journal of Molecular Sciences, Basel, MDPI, 2020, 1422-0067.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW fulltext
Impakt faktor Impact factor: 5.923
Kód RIV RIV/00216224:14740/20:00114234
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.3390/ijms21062065
UT WoS 000529890200161
Klíčová slova anglicky Arabidopsis thaliana; chaperone; flower bud proteome; flower bud transcriptome; male gametophyte; nascent polypeptide-associated complex
Štítky CF PROT, rivok
Změnil Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 31. 8. 2021 16:31.
Anotace
The nascent polypeptide-associated (NAC) complex was described in yeast as a heterodimer composed of two subunits, alpha and beta, and was shown to bind to the nascent polypeptides newly emerging from the ribosomes. NAC function was widely described in yeast and several information are also available about its role in plants. The knock down of individual NAC subunit(s) led usually to a higher sensitivity to stress. In Arabidopsis thaliana genome, there are five genes encoding NAC alpha subunit, and two genes encoding NAC beta. Double homozygous mutant in both genes coding for NAC beta was acquired, which showed a delayed development compared to the wild type, had abnormal number of flower organs, shorter siliques and greatly reduced seed set. Both NAC beta genes were characterized in more detail-the phenotype of the double homozygous mutant was complemented by a functional NAC beta copy. Then, both NAC beta genes were localized to nuclei and cytoplasm and their promoters were active in many organs (leaves, cauline leaves, flowers, pollen grains, and siliques together with seeds). Since flowers were the most affected organs by nac beta mutation, the flower buds' transcriptome was identified by RNA sequencing, and their proteome by gel-free approach. The differential expression analyses of transcriptomic and proteomic datasets suggest the involvement of NAC beta subunits in stress responses, male gametophyte development, and photosynthesis.
Návaznosti
EF16_019/0000738, projekt VaVNázev: Centrum experimentální biologie rostlin
GA18-02448S, projekt VaVNázev: Úloha translačních iniciačních faktorů při skladování a aktivaci transkriptů v samčí zárodečné linii krytosemenných rostlin
Investor: Grantová agentura ČR, Úloha translačních iniciačních faktorů při skladování a aktivaci transkriptů v samčí zárodečné linii krytosemenných rostlin
LM2018127, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LM2018140, projekt VaVNázev: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
VytisknoutZobrazeno: 26. 4. 2024 21:46