Structure of protein from neck of bacteriophage infecting Staphylococcus aureus

BŘENKOVÁ, Barbora; Marta ŠIBOROVÁ; Pavol BÁRDY; Roman PANTŮČEK a Pavel PLEVKA. Structure of protein from neck of bacteriophage infecting Staphylococcus aureus. In XV. Discussions in Structural Molecular Biology. 2018.

Základní údaje

Originální název

Structure of protein from neck of bacteriophage infecting Staphylococcus aureus

Název česky

Struktura proteinu krčku bakteriofága infikujícího Staphylococcus aureus

Autoři

BŘENKOVÁ, Barbora; Marta ŠIBOROVÁ; Pavol BÁRDY; Roman PANTŮČEK a Pavel PLEVKA

Vydání

XV. Discussions in Structural Molecular Biology, 2018

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Prezentace na konferencích

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

Klíčová slova česky

S. aureus, konektor, rentgenová krystalografie

Klíčová slova anglicky

S. aureus, connector, X-ray crystallography

---

Anotace

V originále

Bacteriophage phi812 is a lytic phage from the family Myoviridae. Phi812 infects most staphylococcal strains including those resistant to antibiotics. The structure of this bacteriophage was previously determined by cryo electron microscopy but functions of individual proteins remain unclear. Here we present our work towards resolving the structure of protein gp99 that forms the neck region of phi812. The protein may play a role in a regulation of the genome release from the virion during infection. Gp99 was cloned and expressed in E. coli and purified by affinity and size exclusion chromatography. A suitable crystallization condition was found and X-ray diffraction data with a resolution of 2.3 Å were collected. To solve the phase problem, a variety of methods had been tried, including molecular replacement, heavy atom soaking and co-crystallization, and seleno-methionine incorporation. The structure of gp99 will help explain the mechanism of bacterial infection by bacteriophage. As there is a rising number of antibiotic resistant bacterial strains causing severe illnesses, phage therapy has a high potential. For this purpose, detailed knowledge of bacteria-phage interactions is vital.

Česky

Bakteriofág phi812 je lytický fág z čeledi Myoviridae. Phi812 je schopen infikovat většinu kmenů zlatého stafylokoka, včetně těch multirezistentních. Struktura tohoto bakteriofága byla dříve vyřešena pomocí kryo-elektronové mikroskopie, ale funkce jednotlivých proteinů jsou zatím nejasné. Tato práce ukazuje naši snahu o vyřešení struktury proteinu gp99, který tvoří oblast krčku bakteriofága. Tento protein může hrát roli při regulaci uvolňování genomu z virionu během infekce hostitelské buňky. Gen kódující gp99 byl klonován a exprimován v E. coli a protein byl purifikován afinitní chromatografií a gelovou filtrací. Po nalezení vhodné krystalizační podmínky byla nasbírána rentgenová difrakční data o rozlišení 2.3 Å. Několik metod bylo využito při řešení fázového problému - molekulární nahrazení, inkorporace selenomethioninu nebo těžkých atomů. Struktura proteinu gp99 pomůže vysvětlit mechanismus, kterým bakteriofágy infikují bakterie. Vzhledem k nárůstu počtu bakteriálních kmenů rezistentním k antibiotikům má fágová terapie vysoký klinický potenciál. Proto je důkladná znalost interakcí mezi bakteriofágy a jejich hostitelskými bakteriemi nezbytná.