TROJÁK, Matej, David ŠAFRÁNEK, Lukrécia MERTOVÁ a Luboš BRIM. eBCSgen: A Software Tool for Biochemical Space Language. Online. In Abate A., Petrov T., Wolf V. 18th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, CMSB 2020. LNBI 12314. Neuveden: Springer, 2020, s. 356-361. ISBN 978-3-030-60326-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-60327-4_20.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název eBCSgen: A Software Tool for Biochemical Space Language
Autoři TROJÁK, Matej (703 Slovensko, domácí), David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, garant, domácí), Lukrécia MERTOVÁ (703 Slovensko, domácí) a Luboš BRIM (203 Česká republika, domácí).
Vydání LNBI 12314. Neuveden, 18th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, CMSB 2020, od s. 356-361, 6 s. 2020.
Nakladatel Springer
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání elektronická verze "online"
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 0.402 v roce 2005
Kód RIV RIV/00216224:14330/20:00114395
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 978-3-030-60326-7
ISSN 0302-9743
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-60327-4_20
Klíčová slova anglicky rule-based modelling; parameter synthesis; static analysis; Galaxy tool
Štítky firank_B
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D., učo 3159. Změněno: 15. 4. 2021 11:52.
Anotace
eBCSgen is a tool for development and analysis of models written in Biochemical Space Language (BCSL). BCSL is a rule-based language for biological systems designed to combine compact description with a specific level of abstraction which makes it accessible to users from life sciences. Currently, eBCSgen represents the only tool completely supporting BCSL. It has the form of a command line interface which is integrated into Galaxy – a web-based bioinformatics platform automating data-driven and model-based analysis pipelines
Návaznosti
GA18-00178S, projekt VaVNázev: Diskrétní bifurkační analýza reaktivních systémů
Investor: Grantová agentura ČR, Diskrétní bifurkační analýza reaktivních systémů
MUNI/A/1050/2019, interní kód MUNázev: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace IX (Akronym: SV-FI MAV IX)
Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace IX, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 10. 7. 2024 02:17