Structure-Function Relationships and Engineering of Haloalkane Dehalogenases

KOKKONEN, Piia Pauliina; Táňa KOUDELÁKOVÁ; Radka CHALOUPKOVÁ; Lukáš DANIEL; Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Structure-Function Relationships and Engineering of Haloalkane Dehalogenases. In Aerobic Utilization of Hydrocarbons, Oils, and Lipids. Cham: Springer, 2019, s. 367-387. 1. ISBN 978-3-319-50417-9. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/978-3-319-50418-6_15.

Základní údaje

Originální název

Structure-Function Relationships and Engineering of Haloalkane Dehalogenases

Autoři

KOKKONEN, Piia Pauliina; Táňa KOUDELÁKOVÁ; Radka CHALOUPKOVÁ; Lukáš DANIEL; Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ

Vydání

Cham, Aerobic Utilization of Hydrocarbons, Oils, and Lipids, od s. 367-387, 21 s. 1. 2019

Nakladatel

Springer

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Kapitola resp. kapitoly v odborné knize

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Švýcarsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Odkazy

URL

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/19:00119131

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-3-319-50417-9

DOI

https://doi.org/10.1007/978-3-319-50418-6_15

UT WoS

000623123900015

Klíčová slova anglicky

haloalkane dehalogenase; protein engineering

Štítky

topvydavatel

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

The structure-function relationships for haloalkane dehalogenases, one of the best characterized enzyme families involved in degradation of halogenated compounds, are described. A substantial amount of mechanistic and structural information is currently available on haloalkane dehalogenases, providing good theoretical framework for their modification by protein engineering. Examples of constructed mutants include variants with modified (i) activity and specificity, (ii) stability, and (ii) enantioselectivity. Many variants carried mutations in the tunnels connecting the buried active site with surrounding solvent, rather than in the active site itself. Mutagenesis of residues lining the protein tunnels represents attractive and a viable approach of protein engineering.

---

Návaznosti

GA16-06096S, projekt VaV	Název: Objasnění významu dynamických tunelů pro enzymatickou katalýzu: simulace a fluorescenční experimenty Investor: Grantová agentura ČR, Objasnění významu dynamických tunelů pro enzymatickou katalýzu: simulace a fluorescenční experimenty
GA16-07965S, projekt VaV	Název: Řízená evoluce dynamických elementů v enzymech s využitím mikrofluidních čipů Investor: Grantová agentura ČR, Řízená evoluce dynamických elementů v enzymech s využitím mikrofluidních čipů
GA16-24223S, projekt VaV	Název: Strukturní podstata vzniku nových enzymových aktivit Investor: Grantová agentura ČR, Strukturní podstata vzniku nových enzymových aktivit
LM2015051, projekt VaV	Název: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX RI) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumná infrastruktura RECETOX
LM2015055, projekt VaV	Název: Centrum pro systémovou biologii (Akronym: C4SYS) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, The national infrastructure C4SYS - Centre for Systems Biology
LM2015085, projekt VaV	Název: CERIT Scientific Cloud (Akronym: CERIT-SC) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CERIT Scientific Cloud
LO1214, projekt VaV	Název: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (Akronym: RECETOX) Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí
676559, interní kód MU	Název: ELIXIR-EXCELERATE: Fast-track ELIXIR implementation and drive early user exploitation across the life-sciences (Akronym: ELIXIR-EXCELERATE) Investor: Evropská unie, ELIXIR-EXCELERATE: Fast-track ELIXIR implementation and drive early user exploitation across the life-sciences, RI Research Infrastructures (Excellent Science)
90042, velká výzkumná infrastruktura	Název: CESNET II