a 2021

ČERNÝ FOSFOR PRO CITLIVÉ KLINICKÉ APLIKACE V HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRII BIOMOLEKUL

MANDAL, Govinda; Lukáš PEČINKA; Lukáš MORÁŇ; Petr VAŇHARA; Josef HAVEL et al.

Základní údaje

Originální název

ČERNÝ FOSFOR PRO CITLIVÉ KLINICKÉ APLIKACE V HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRII BIOMOLEKUL

Název česky

ČERNÝ FOSFOR PRO CITLIVÉ KLINICKÉ APLIKACE V HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRII BIOMOLEKUL

Vydání

XXIV. Biological Days, Czech-Slovak Biological Society, Brno-Masaryk University Campus, Czech Republic, September 6-7, 2021. 2021

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10406 Analytical chemistry

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta
Změněno: 22. 9. 2021 10:06, Govinda Mandal, Ph.D.

Anotace

V originále

Černý fosfor (BP) představuje nejstabilnější alotropickou modifikaci fosforu s jedinečnými fyzikálně-chemickými vlastnostmi a s vysokým počtem biologických aplikací1. Běžně používané organické matrice mohou trpět řadou nedostatků, jako je například nízká ionizační účinnost a reprodukovatelnost při aplikaci na komplexní biologické vzorky, jako jsou buněčné extrakty. V současné době je velký zájem o nahrazení/modifikaci organických matric použitím anorganických materiálů jako jsou kovové nanočástice a kovové vrstvy. Tyto anorganické materiály poskytují minimální interference v hmotnostních spektrech (nízká fragmentace) a zlepšují ionizaci biomolekul. Černý fosfor selektivně zvyšuje ionizaci některých bio-molekul v MALDI TOF MS, avšak tento jev není zatím dostatečně vysvětlen2,3. V této studii byl BP v kombinaci s běžně používanými matricemi použit pro systematickou MS analýzu vybraných biomolekul (aminokyselin, peptidů a proteinů) a intaktních buněk. Cílem této práce je shrnout, jak BP zlepšuje ionizaci těchto bio-molekul a demonstrovat možnost použití BP pro buněčnou diskriminaci. Účinnost ionizace v matricích obohacených BP byla významně zvýšena a výsledné intenzity analytů v hmotnostních spektrech byly ~4-417krát vyšší než ve spektrech získaných s použitím běžných matric. Bylo také prokázáno, že organická matrice (kyselina sinapová) obohacená BP zlepšuje analýzu MALDI TOF MS intaktních buněk. Analýza hlavních komponent (PCA) ukazuje zlepšení v rozlišení buněk při použití BP obohacené matrice. BP zvyšuje ionizaci široké skupiny biomolekul a tím zlepšuje biologické aplikace MALDI TOF MS.

Česky

Černý fosfor (BP) představuje nejstabilnější alotropickou modifikaci fosforu s jedinečnými fyzikálně-chemickými vlastnostmi a s vysokým počtem biologických aplikací1. Běžně používané organické matrice mohou trpět řadou nedostatků, jako je například nízká ionizační účinnost a reprodukovatelnost při aplikaci na komplexní biologické vzorky, jako jsou buněčné extrakty. V současné době je velký zájem o nahrazení/modifikaci organických matric použitím anorganických materiálů jako jsou kovové nanočástice a kovové vrstvy. Tyto anorganické materiály poskytují minimální interference v hmotnostních spektrech (nízká fragmentace) a zlepšují ionizaci biomolekul. Černý fosfor selektivně zvyšuje ionizaci některých bio-molekul v MALDI TOF MS, avšak tento jev není zatím dostatečně vysvětlen2,3. V této studii byl BP v kombinaci s běžně používanými matricemi použit pro systematickou MS analýzu vybraných biomolekul (aminokyselin, peptidů a proteinů) a intaktních buněk. Cílem této práce je shrnout, jak BP zlepšuje ionizaci těchto bio-molekul a demonstrovat možnost použití BP pro buněčnou diskriminaci. Účinnost ionizace v matricích obohacených BP byla významně zvýšena a výsledné intenzity analytů v hmotnostních spektrech byly ~4-417krát vyšší než ve spektrech získaných s použitím běžných matric. Bylo také prokázáno, že organická matrice (kyselina sinapová) obohacená BP zlepšuje analýzu MALDI TOF MS intaktních buněk. Analýza hlavních komponent (PCA) ukazuje zlepšení v rozlišení buněk při použití BP obohacené matrice. BP zvyšuje ionizaci široké skupiny biomolekul a tím zlepšuje biologické aplikace MALDI TOF MS.

Návaznosti

MUNI/A/1421/2019, interní kód MU
Název: Analytické a fyzikálně-chemické metody ve výzkumu geologických, biologických a syntetických materiálů (Akronym: AFCHMAT)
Investor: Masarykova univerzita, Analytické a fyzikálně-chemické metody ve výzkumu geologických, biologických a syntetických materiálů, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
MUNI/A/1689/2020, interní kód MU
Název: Zdroje pro tkáňové inženýrství 11 (Akronym: TissueEng 11)
Investor: Masarykova univerzita, Zdroje pro tkáňové inženýrství 11
NV18-08-00299, projekt VaV
Název: Nové nástroje pro kontrolu kvality pluripotentních kmenových buněk a progenitorů určených pro klinické aplikace