KŘIVÁNEK, Jan, Josef LAVICKÝ, Thibault BOUDERLIQUE a Igor ADAMEYKO. Rapid Isolation of Single Cells from Mouse and Human Teeth. Jove-Journal of Visualized Experiments. CAMBRIDGE: JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, 2021, roč. 2021, č. 176, s. 1-12. ISSN 1940-087X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3791/63043.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Rapid Isolation of Single Cells from Mouse and Human Teeth
Autoři KŘIVÁNEK, Jan (203 Česká republika, garant, domácí), Josef LAVICKÝ (203 Česká republika, domácí), Thibault BOUDERLIQUE a Igor ADAMEYKO.
Vydání Jove-Journal of Visualized Experiments, CAMBRIDGE, JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, 2021, 1940-087X.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10601 Cell biology
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 1.424
Kód RIV RIV/00216224:14110/21:00124075
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.3791/63043
UT WoS 000715060500029
Klíčová slova anglicky Mouse and Human Teeth; Single Cells; Rapid Isolation
Štítky 14110517, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 17. 5. 2022 13:06.
Anotace
Mouse and human teeth represent challenging organs for quick and efficient cell isolation for single-cell transcriptomic or other applications. The dental pulp tissue, rich in the extracellular matrix, requires a long and tedious dissociation process that is typically beyond the reasonable time for single-cell transcriptomics. For avoiding artificial changes in gene expression, the time elapsed from euthanizing an animal until the analysis of single cells needs to be minimized. This work presents a fast protocol enabling to obtain single-cell suspension from mouse and human teeth in an excellent quality suitable for scRNA-seq (single-cell RNA-sequencing). This protocol is based on accelerated tissue isolation steps, enzymatic digestion, and subsequent preparation of final single-cell suspension. This enables fast and gentle processing of tissues and allows using more animal or human samples for obtaining cell suspensions with high viability and minimal transcriptional changes. It is anticipated that this protocol might guide researchers interested in performing the scRNA-seq not only on the mouse or human teeth but also on other extracellular matrix-rich tissues, including cartilage, dense connective tissue, and dermis.
Návaznosti
MUNI/H/1615/2018, interní kód MUNázev: Understanding of tooth developmental trajectories as a novel approach for dental regeneration
Investor: Masarykova univerzita, Understanding of tooth developmental trajectories as a novel approach for dental regeneration, Individuální projekty hraničního výzkumu
MUNI/IGA/1532/2020, interní kód MUNázev: Investigation of the role of FoxD1+ stem cells during craniofacial development (Akronym: FoxD1 stem cells in craniofacial development)
Investor: Masarykova univerzita, Investigation of the role of FoxD1+ stem cells during craniofacial development
VytisknoutZobrazeno: 21. 5. 2024 20:16