J 2022

arakno - An R package for effective spider nomenclature, distribution and trait data retrieval from online resources

CARDOSO, Pedro a Stanislav PEKÁR

Základní údaje

Originální název

arakno - An R package for effective spider nomenclature, distribution and trait data retrieval from online resources

Autoři

CARDOSO, Pedro (garant) a Stanislav PEKÁR (703 Slovensko, domácí)

Vydání

Journal of Arachnology, MD USA, American Arachnological Society, 2022, 0161-8202

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10616 Entomology

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 1.000

Kód RIV

RIV/00216224:14310/22:00128117

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

DOI

UT WoS

000791316800005

Klíčová slova anglicky

Araneae; biological traits; functional diversity; geographical range; taxonomy

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 3. 4. 2023 11:50, Mgr. Marie Šípková, DiS.

Anotace

V originále

Online open databases are increasing in number, usefulness, and ease of use. There are currently two main global databases for spiders, the World Spider Catalogue (WSC) and the World Spider Trait (WST) database. Both are regularly used by thousands of researchers. Computational tools that allow effective processing of large data are now part of the workflow of any researcher and R is becoming a de facto standard for data manipulation, analysis, and presentation. Here we present an R package, arakno, that allows interface with the two databases. Implemented tools include checking species names against nomenclature of the WSC, obtaining and mapping data on distribution of species from both the WST and the Global Biodiversity Information Facility (GBIF), and downloading trait data from the WST. A set of tools are also provided to prepare data for further statistical analysis.