FAJKUS, Petr, Matej ADÁMIK, Andrew D L NELSON, Agata Magdalena KILAR, Michal FRANEK, Michal BUBENÍK, Radmila Capkova FRYDRYCHOVA, Alena VOTAVOVA, Eva SÝKOROVÁ, Jiří FAJKUS a Vratislav PEŠKA. Telomerase RNA in Hymenoptera (Insecta) switched to plant/ciliate-like biogenesis. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2023, roč. 51, č. 1, s. 420-433. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkac1202.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Telomerase RNA in Hymenoptera (Insecta) switched to plant/ciliate-like biogenesis
Autoři FAJKUS, Petr (203 Česká republika, domácí), Matej ADÁMIK (703 Slovensko), Andrew D L NELSON, Agata Magdalena KILAR (616 Polsko, domácí), Michal FRANEK (703 Slovensko, domácí), Michal BUBENÍK (203 Česká republika, domácí), Radmila Capkova FRYDRYCHOVA, Alena VOTAVOVA, Eva SÝKOROVÁ (203 Česká republika), Jiří FAJKUS (203 Česká republika, garant, domácí) a Vratislav PEŠKA (203 Česká republika).
Vydání Nucleic acids research, Oxford, Oxford University Press, 2023, 0305-1048.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 14.900 v roce 2022
Kód RIV RIV/00216224:14740/23:00130297
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkac1202
UT WoS 000902076600001
Klíčová slova anglicky TEMPLATE-BOUNDARY DEFINITION;PSEUDOKNOT;SEQUENCE;IDENTIFICATION
Štítky CF GEN, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc., učo 28574. Změněno: 27. 2. 2024 08:44.
Anotace
In contrast to the catalytic subunit of telomerase, its RNA subunit (TR) is highly divergent in size, sequence and biogenesis pathways across eukaryotes. Current views on TR evolution assume a common origin of TRs transcribed with RNA polymerase II in Opisthokonta (the supergroup including Animalia and Fungi) and Trypanosomida on one hand, and TRs transcribed with RNA polymerase III under the control of type 3 promoter, found in TSAR and Archaeplastida supergroups (including e.g. ciliates and Viridiplantae taxa, respectively). Here, we focus on unknown TRs in one of the largest Animalia order - Hymenoptera (Arthropoda) with more than 300 available representative genomes. Using a combination of bioinformatic and experimental approaches, we identify their TRs. In contrast to the presumed type of TRs (H/ACA box snoRNAs transcribed with RNA Polymerase II) corresponding to their phylogenetic position, we find here short TRs of the snRNA type, likely transcribed with RNA polymerase III under the control of the type 3 promoter. The newly described insect TRs thus question the hitherto assumed monophyletic origin of TRs across Animalia and point to an evolutionary switch in TR type and biogenesis that was associated with the divergence of Arthropods.
Návaznosti
GX20-01331X, projekt VaVNázev: Biogeneze a evoluce telomerázy u rostlin
Investor: Grantová agentura ČR, Biogenesis and evolution of telomerase in plants
LM2018131, projekt VaVNázev: Česká národní infrastruktura pro biologická data (Akronym: ELIXIR-CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Česká národní infrastruktura pro biologická data
LM2018132, projekt VaVNázev: Národní centrum lékařské genomiky (Akronym: NCLG)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní centrum lékařské genomiky
LM2018140, projekt VaVNázev: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
VytisknoutZobrazeno: 6. 5. 2024 16:43