Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
@proceedings{2259017, author = {Zettlová, Kateřina and Zámečníková, Lenka and Vrbský, Jan and Vacek, Lukáš and Dvořáčková, Milada}, booktitle = {Celostátní konference DNA diagnostiky ČLS JEP}, keywords = {NGS, SARS-CoV-2, VOC, mutation}, title = {Diagnostika viru SARS-CoV-2 pomocí NGS ve FN u sv. Anny v Brně}, url = {https://drive.google.com/file/d/1g_WTnyR0YCweFYL8oTCYExhXz7tSSoIo/view}, year = {2022} }
TY - CONF ID - 2259017 AU - Zettlová, Kateřina - Zámečníková, Lenka - Vrbský, Jan - Vacek, Lukáš - Dvořáčková, Milada PY - 2022 TI - Diagnostika viru SARS-CoV-2 pomocí NGS ve FN u sv. Anny v Brně KW - NGS, SARS-CoV-2, VOC, mutation UR - https://drive.google.com/file/d/1g_WTnyR0YCweFYL8oTCYExhXz7tSSoIo/view N2 - V souladu s "Národní strategií molekulárně-biologické surveillance SARS-CoV-2" bylo v dubnu 2021 zahájeno celogenomové sekvenování vzorků pozitivních na SARS-CoV-2 za účelem identifikace variant viru vyskytujících se na našem území. Covidová laboratoř Mikrobiologického ústavu FN u sv. Anny v Brně byla do sekvenační sítě zapojena v říjnu 2021. Doposud bylo námi do celosvětové databáze GISAID (www.gisaid.org) nahráno přes 2000 sekvencí. Od ledna 2022 dominovala varianta nazvaná Omicron. Zpočátku jsme detekovali její nejrozšířenější subvariantu BA.1 a její další linie. V reálném čase jsme zaznamenali rozšíření subvarianty BA.2 a jejích linií, která velmi rychle vytlačila subvariantu BA.1 a v současné době dominuje. V krátkém časovém úseku jsme zaznamenali vysoký počet změn virového genomu, včetně vzniku rekombinantní varianty. Konkrétně jsme se zaměřili na srovnání středoevropských mutací s mutacemi detekovanými ve Velké Británii, srovnali jsme stejné období a stejný počet vzorků, přičemž jsme zjišťovali výskyt unikátních mutací v naší populaci. Jako první v ČR jsme zachytili rekombinantní variantu BA.XJ jejíž nomenklatura se v mezinárodních databázích dynamicky mění. ER -
ZETTLOVÁ, Kateřina, Lenka ZÁMEČNÍKOVÁ, Jan VRBSKÝ, Lukáš VACEK a Milada DVOŘÁČKOVÁ. Diagnostika viru SARS-CoV-2 pomocí NGS ve FN u sv. Anny v Brně. In \textit{Celostátní konference DNA diagnostiky ČLS JEP}. 2022.
|