SELINGER, Martin, Radim NOVOTNY, Jakub SYS, Justin A ROBY, Hana TYKALOVA, Sri Ranjani GANJI, Marie VANCOVA, Katerina JAKLOVA, Filip KAUFMAN, Marshall E BLOOM, Zbyněk ZDRÁHAL, Libor GRUBHOFFER, Jade K FORWOOD, Richard HRABAL, Michaela RUMLOVA a Jan STERBA. Tick-borne encephalitis virus capsid protein induces translational shutoff as revealed by its structural-biological analysis. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. ELSEVIER, 2022, roč. 298, č. 11, s. 102585-102608. ISSN 1083-351X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jbc.2022.102585.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Tick-borne encephalitis virus capsid protein induces translational shutoff as revealed by its structural-biological analysis
Autoři SELINGER, Martin, Radim NOVOTNY, Jakub SYS, Justin A ROBY, Hana TYKALOVA, Sri Ranjani GANJI (356 Indie, domácí), Marie VANCOVA, Katerina JAKLOVA, Filip KAUFMAN, Marshall E BLOOM, Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, garant, domácí), Libor GRUBHOFFER, Jade K FORWOOD, Richard HRABAL, Michaela RUMLOVA a Jan STERBA.
Vydání JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, ELSEVIER, 2022, 1083-351X.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10608 Biochemistry and molecular biology
Stát vydavatele Nizozemské království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 4.800
Kód RIV RIV/00216224:14740/22:00128827
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.jbc.2022.102585
UT WoS 000917299600007
Klíčová slova anglicky Capsid; Capsid Proteins; Encephalitis Viruses; Tick-Borne; RNA; Viral Nonstructural Proteins
Štítky CF PROT, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 4. 2023 10:48.
Anotace
Tick-borne encephalitis virus (TBEV) is the most medically relevant tick-transmitted Flavivirus in Eurasia, targeting the host central nervous system and frequently causing severe encephalitis. The primary function of its capsid protein (TBEVC) is to recruit the viral RNA and form a nucleocapsid. Additional functionality of Flavivirus capsid proteins has been documented, but further investigation is needed for TBEVC. Here, we show the first capsid protein 3D structure of a member of the tick-borne flaviviruses group. The structure of monomeric Δ16-TBEVC was determined using high-resolution multidimensional NMR spectroscopy. Based on natural in vitro TBEVC homodimerization, the dimeric interfaces were identified by hydrogen deuterium exchange mass spectrometry (MS). Although the assembly of flaviviruses occurs in endoplasmic reticulum–derived vesicles, we observed that TBEVC protein also accumulated in the nuclei and nucleoli of infected cells. In addition, the predicted bipartite nuclear localization sequence in the TBEVC C-terminal part was confirmed experimentally, and we described the interface between TBEVC bipartite nuclear localization sequence and import adapter protein importin-alpha using X-ray crystallography. Furthermore, our coimmunoprecipitation coupled with MS identification revealed 214 interaction partners of TBEVC, including viral envelope and nonstructural NS5 proteins and a wide variety of host proteins involved mainly in rRNA processing and translation initiation. Metabolic labeling experiments further confirmed that TBEVC and other flaviviral capsid proteins are able to induce translational shutoff and decrease of 18S rRNA. These findings may substantially help to design a targeted therapy against TBEV.
Návaznosti
EF16_026/0008446, projekt VaVNázev: Integrace signálu a epigenetické reprogramování pro produktivitu rostlin
LM2018127, projekt VaVNázev: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology
LM2018140, projekt VaVNázev: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
LX22NPO5103, projekt VaVNázev: Národní institut virologie a bakteriologie (Akronym: NIVB)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Národní institut virologie a bakteriologie, 5.1 EXCELES
VytisknoutZobrazeno: 28. 4. 2024 12:07