a 2022

Characterization of the NSE6 subunit of the Physcomitrium patens SMC5/6 complex

JEMELKOVÁ, Jitka; Edit LELKES; Marcela HOLÁ; Barbora ŠTEFANOVIE; Peter KOLESÁR et al.

Základní údaje

Originální název

Characterization of the NSE6 subunit of the Physcomitrium patens SMC5/6 complex

Autoři

JEMELKOVÁ, Jitka; Edit LELKES; Marcela HOLÁ; Barbora ŠTEFANOVIE; Peter KOLESÁR; Karel J. ANGELIS a Jan PALEČEK

Vydání

2022

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10700 1.7 Other natural sciences

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 4. 8. 2023 12:39, Mgr. Jitka Vaculíková, Ph.D.

Anotace

V originále

Structural Maintenance of Chromosome (SMC) complexes are molecular machines ensuring chromatin organization at higher levels. They play direct roles in cohesion, condensation, replication, transcription and DNA repair. Their cores are composed of long-armed SMC, kleisin, and kleisin-associated KITE or HAWK subunits. Additional NSE5 and NSE6 regulatory subunits interact with both SMC5 and SMC6 arms. Although their amino acid sequences are poorly conserved across the species, their primary function is to target SMC5/6 to the DNA damage sites. To characterize the NSE6 subunit of moss Physcomitrium patens, we analyzed its protein-protein interactions and Ppnse6 mutant phenotypes. In the human HsNSE6, we recently identified a new CANIN (for Coiled-coil SMC6 And NSE5 INteracting) domain. To further explore the conservation of this domain, we tracked down its sequence homology to lower plants and characterized its most conserved motif required for binding to its NSE5 partner. In addition, the CANIN domain and its preceding sequences bind and link SMC5 and SMC6 arms, suggesting its role in SMC5/6 dynamics. We hypothesized that this bridging of SMC5-SMC6 arms might negatively impact their dynamics, e.g. by limiting the opening of the SMC5/6 ring upon ATP binding.

Návaznosti

GA20-05095S, projekt VaV
Název: Úloha komplexu SMC5/6 a jeho interakčních partnerů v opravě poškozené DNA (Akronym: SMC5/6)
Investor: Grantová agentura ČR, Úloha komplexu SMC5/6 a jeho interakčních partnerů v opravě poškozené DNA