Extraction Protocol for Parallel Analysis of Proteins and DNA
from Ancient Teeth and Dental Calculus

J 2023

Extraction Protocol for Parallel Analysis of Proteins and DNA from Ancient Teeth and Dental Calculus

CHOCHOLOVÁ, Eva; Pavel ROUDNICKÝ; David POTĚŠIL; Dana FIALOVÁ; Karolína KRYŠTOFOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Extraction Protocol for Parallel Analysis of Proteins and DNA from Ancient Teeth and Dental Calculus

Autoři

CHOCHOLOVÁ, Eva ; Pavel ROUDNICKÝ; David POTĚŠIL; Dana FIALOVÁ; Karolína KRYŠTOFOVÁ ; Eva DROZDOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL

Vydání

Journal of Proteome Research, American Chemical Society, 2023, 1535-3893

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 3.800

Kód RIV

RIV/00216224:14740/23:00131731

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.3c00370

UT WoS

001067227500001

EID Scopus

2-s2.0-85172869751

Klíčová slova anglicky

bioarcheology; paleoproteomics; ancientDNA; ancientproteins; dental calculus

Štítky

14314010, 143160, CF PROT, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 8. 12. 2025 10:32, Mgr. Eva Dubská

Anotace

V originále

Dental calculus is becoming a crucial material in the study of past populations with increasing interest in its proteomic and genomic content. Here, we suggest further development of a protocol for analysis of ancient proteins and a combined approach for subsequent ancient DNA extraction. We tested the protocol on recent teeth, and the optimized protocol was applied to ancient tooth to limit the destruction of calculus as it is a precious and irreplaceable source of dietary, microbiological, and ecological information in the archeological context. Finally, the applicability of the protocol was demonstrated on samples of the ancient calculus.

Návaznosti

EF18_046/0015974, projekt VaV

Název: Modernizace České infrastruktury pro integrativní strukturní biologii

LM2018127, projekt VaV

Název: Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii (Akronym: CIISB)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology

LM2018140, projekt VaV

Název: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ

MUNI/A/1325/2021, interní kód MU

Název: Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 10 (Akronym: MBG10)

Investor: Masarykova univerzita, Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 10

MUNI/A/1522/2020, interní kód MU

Název: Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 9 (Akronym: MBG9)

Investor: Masarykova univerzita, Podpora výzkumné činnosti studentů molekulární biologie a genetiky 9

Citovat

CHOCHOLOVÁ, Eva; Pavel ROUDNICKÝ; David POTĚŠIL; Dana FIALOVÁ; Karolína KRYŠTOFOVÁ; Eva DROZDOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. Extraction Protocol for Parallel Analysis of Proteins and DNA from Ancient Teeth and Dental Calculus. Journal of Proteome Research. American Chemical Society, 2023, roč. 22, č. 10, s. 3311-3319. ISSN 1535-3893. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.3c00370.

@article{2313637,
   author = {Chocholová, Eva and Roudnický, Pavel and Potěšil, David and Fialová, Dana and Kryštofová, Karolína and Drozdová, Eva and Zdráhal, Zbyněk},
   article_number = {10},
   doi = {https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.3c00370},
   keywords = {bioarcheology; paleoproteomics; ancientDNA; ancientproteins; dental calculus},
   language = {eng},
   issn = {1535-3893},
   journal = {Journal of Proteome Research},
   title = {Extraction Protocol for Parallel Analysis of Proteins and DNA from Ancient Teeth and Dental Calculus},
   url = {https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.3c00370},
   volume = {22},
   year = {2023}
}

TY  - JOUR
ID  - 2313637
AU  - Chocholová, Eva - Roudnický, Pavel - Potěšil, David - Fialová, Dana - Kryštofová, Karolína - Drozdová, Eva - Zdráhal, Zbyněk
PY  - 2023
TI  - Extraction Protocol for Parallel Analysis of Proteins and DNA from Ancient Teeth and Dental Calculus
JF  - Journal of Proteome Research
VL  - 22
IS  - 10
SP  - 3311-3319
EP  - 3311-3319
PB  - American Chemical Society
SN  - 15353893
KW  - bioarcheology
KW  - paleoproteomics
KW  - ancientDNA
KW  - ancientproteins
KW  - dental calculus
UR  - https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.3c00370
N2  - Dental calculus is becoming a crucial material in the study of past populations with increasing interest in its proteomic and genomic content. Here, we suggest further development of a protocol for analysis of ancient proteins and a combined approach for subsequent ancient DNA extraction. We tested the protocol on recent teeth, and the optimized protocol was applied to ancient tooth to limit the destruction of calculus as it is a precious and irreplaceable source of dietary, microbiological, and ecological information in the archeological context. Finally, the applicability of the protocol was demonstrated on samples of the ancient calculus.
ER  -

CHOCHOLOVÁ, Eva; Pavel ROUDNICKÝ; David POTĚŠIL; Dana FIALOVÁ; Karolína KRYŠTOFOVÁ; Eva DROZDOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. Extraction Protocol for Parallel Analysis of Proteins and DNA from Ancient Teeth and Dental Calculus. \textit{Journal of Proteome Research}. American Chemical Society, 2023, roč.~22, č.~10, s.~3311-3319. ISSN~1535-3893. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.3c00370.

Přehled o publikaci