J 2023

Challenges of <i>in situ</i> hybridization in miRNA analysis of triple-negative breast cancer morphological diversity

KOLECKOVA, Marketa, Michala BEZDEKOVA, Jan BOUCHAL, Maria JANIKOVA, Júlia BOHOŠOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Challenges of <i>in situ</i> hybridization in miRNA analysis of triple-negative breast cancer morphological diversity

Autoři

KOLECKOVA, Marketa, Michala BEZDEKOVA, Jan BOUCHAL, Maria JANIKOVA, Júlia BOHOŠOVÁ (703 Slovensko, domácí), Ondřej SLABÝ (203 Česká republika, domácí), Marek SVOBODA (203 Česká republika, domácí), Josef SROVNAL, Katherine VOMACKOVA, Ivo UBERALL a Zdenek KOLAR (garant)

Vydání

Neoplasma, Bratislava, Slovenská akademie vied, 2023, 0028-2685

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30204 Oncology

Stát vydavatele

Slovensko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 3.000 v roce 2022

Kód RIV

RIV/00216224:14740/23:00133481

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

UT WoS

001070933100001

Klíčová slova anglicky

triple-negative breast cancer (TNBC); miRNA; in situ hybridization; RT-qPCR

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 3. 3. 2024 22:29, Mgr. Eva Dubská

Anotace

V originále

miRNA expression in triple-negative breast cancers (TNBC) has mainly been studied from a methodological viewpoint. However, it has not been considered that miRNA expression profile may be associated with a specific morphological entity inside every tumor. The verification of this hypothesis on a set of 25 TNBCs was the subject of our previous work, where we confirmed specific expression of the studied miRNAs in 82 samples of different morphologies including inflammatory infiltrate, spindle cell, clear cell, and metastases after RNA extraction and purification as well as microchip and biostatistical analysis. In the current work, we demonstrate a low suitability of in situ hybridization method for miRNA detection compared to RT-qPCR, and in detail discuss the biological role of 8 miRNAs with the most significant changes of expression.