R 2023

MAPHIS - Measuring arthropod phenotypes using hierarchical image segmentations

MRÁZ, Radoslav; Karel ŠTĚPKA; Matěj PEKÁR; Petr MATULA; Stanislav PEKÁR et. al.

Základní údaje

Originální název

MAPHIS - Measuring arthropod phenotypes using hierarchical image segmentations

Autoři

Vydání

2023

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Software

Obor

10200 1.2 Computer and information sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Kód RIV

RIV/00216224:14330/23:00133697

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

DOI

EID Scopus

2-s2.0-85176774787

Klíčová slova anglicky

arachnids;arthropods;convolutional neural networks;hierarchical segmentation;image analysis;insects;machine vision;morphological traits

Technické parametry

Verejne dostupný open-source software vydaný pod GNU General Public License

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 29. 2. 2024 16:50, Mgr. Radoslav Mráz

Anotace

V originále

MAPHIS is an open-source application allowing users to create hierarchichal segmentations of arthropods, extract various measurements from the generated segmentations and finally export the measurements for further analysis. The application features an automatic segmentation method (with the use of a convolutional neural network) and several interactive tools. Furthermore, through its plugin system users can extend or customize the capabilities of the application.

Návaznosti

GA19-09323S, projekt VaV
Název: Mimetické komplexy a evoluce nepřesných mimetiků
Investor: Grantová agentura ČR, Mimetic complexes and the evolution of inaccurate mimics
LM2023050, projekt VaV
Název: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech BioImaging: Národní výzkumná infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování