Genetická struktura středoevropských populací myšice temnopásé (Apodemus agrarius)

CHALUPOVÁ, Veronika; Malahatosadat DIANAT; Filip TULIS; Ivan BALÁŽ; Győző HORVÁTH; Ana Maria BENEDEK-SÎRBU a Adam KONEČNÝ. Genetická struktura středoevropských populací myšice temnopásé (Apodemus agrarius). In Zoologické dny Brno 2023. 2023. ISBN 978-80-87189-39-9.

Základní údaje

Originální název

Genetická struktura středoevropských populací myšice temnopásé (Apodemus agrarius)

Název česky

Genetická struktura středoevropských populací myšice temnopásé (Apodemus agrarius)

Název anglicky

Genetic structures of the Central European striped field mouse (Apodemus agrarius) populations

Autoři

CHALUPOVÁ, Veronika; Malahatosadat DIANAT; Filip TULIS; Ivan BALÁŽ; Győző HORVÁTH; Ana Maria BENEDEK-SÎRBU a Adam KONEČNÝ

Vydání

Zoologické dny Brno 2023, 2023

---

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10613 Zoology

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/23:00140245

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-87189-39-9

Klíčová slova česky

myšice temnopásá; ddRAD sekvenování; expanze; populační historie; SNP

Klíčová slova anglicky

striped field mouse; ddRAD sequencing; expansion; population history; SNP

---

Anotace

V originále

Myšice temnopásá (Apodemus agrarius) je drobný myšovitý hlodavec původem z východní Asie, odkud expandovala přes Rusko až do západní Evropy; její rozšíření tak pokrývá většinu palearktického regionu. Kolonizace střední Evropy proběhla pravděpodobně v průběhu holocénu vlivem klimatických změn, které způsobily vznik otevřenějších habitatů. Kvůli relativně nedávné expanzi nevykazují evropské populace myšice temnopásé výraznou genetickou variabilitu (mtDNA, mikrosatelity), a je tudíž složité studovat historii jejich šíření. Tento problém byl vyřešen použitím metody ddRAD sekvenování, která poskytla velký počet jednonukleotidových polymorfismů (SNP) napříč celým genomem. Celkově jsme tímto způsobem získali genetická data od 96 jedinců z třiceti lokalit ze sedmi středoevropských zemí. Naše výsledky poprvé ukazují jasnou genetickou strukturu populací myšice temnopásé v Evropě, ve které se zároveň odráží potenciální cesty šíření z východu. Analýza genetické struktury rozlišila tři hlavní populační jednotky ve střední Evropě: v oblasti Panonské pánve, v severní části Evropy (od severního Česka a Slovenska dál na sever) a na Moravě. V rámci takto definovaných populací je navíc patrná i detailnější substruktura. Geografická lokalizace těchto tří hlavních populací naznačuje, že šíření do střední Evropy proběhlo severní a jižní cestou, které se rozdělovaly podél Karpat. Dále se ukazuje, že dochází ke kontaktu mezi jedinci ze severní a panonské populace, což vzbuzuje další otázky o úrovni jejich promíchání a případného potenciálu k expanzi či fluktuaci areálu myšice temnopásé. Rozšíření datasetu o nové lokality umožní získat ucelenější vhled do evoluční historie populací myšice temnopásé v Evropě a pomůže pochopit procesy, které determinují okraj areálu rozšíření a jeho fluktuace.

Anglicky

The striped field mouse (Apodemus agrarius) is a small murine rodent native to East Asia, from where it expanded through Russia all the way to Western Europe; its distribution thus covers most of the Palearctic region. The colonization of Central Europe likely occurred during the Holocene as a result of climate changes that led to the formation of more open habitats. Due to its relatively recent expansion, European populations of the striped field mouse do not show significant genetic variability (mtDNA, microsatellites), making it difficult to study the history of its spread. This problem was addressed using the ddRAD sequencing method, which provided a large number of single nucleotide polymorphisms (SNPs) across the entire genome. Using this method, we obtained genetic data from 96 individuals from thirty locations in seven Central European countries. Our results, for the first time, show a clear genetic structure of striped field mouse populations in Europe, which also reflects potential east-to-west migration routes. The analysis of genetic structure identified three main population units in Central Europe: in the Pannonian Basin, in the northern part of Europe and in Moravia. Within these defined populations, a more detailed substructure is also apparent. The geographic localization of these three main populations suggests that the spread into Central Europe occurred via both northern and southern routes, which split along the Carpathians. Additionally, there is evidence of contact between individuals from the northern and Pannonian populations, raising further questions about the level of their admixture and the potential for expansion or fluctuation of the striped field mouse’s range. Expanding the dataset to include new locations will provide a more comprehensive insight into the evolutionary history of striped field mouse populations in Europe and help to understand the processes that determine the edges of its distribution and their fluctuations.