R 2024

COMPYDA: An online tool for verifying the similarity of image datasets

NEČASOVÁ, Tereza; Daniel MÚČKA a David SVOBODA

Základní údaje

Originální název

COMPYDA: An online tool for verifying the similarity of image datasets

Autoři

Vydání

2024

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Software

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14330/24:00136232

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

Web-service; Statistics; Data validation; Image descriptors; Privacy; Augmented data

Technické parametry

Veřejně dostupný open-source software vydaný pod GNU General Public License

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 7. 4. 2025 17:13, RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D.

Anotace

V originále

Nowadays, when the vast majority of biomedical research relies on machine learning methods, paying attention to the meaningfulness of the data we work with is crucial. This is especially true if the dataset is scarce and we are required to use various augmentation techniques to enlarge training sets. The additional data are, however, not guaranteed to have the same characteristics as the original data, and therefore, the augmented set may be inconsistent. This can subsequently lead to incorrect training of biomedical image analysis methods, which may result in biased classification, detection, segmentation, or tracking results. We present an online tool called COMPYDA (COMPare Your DAta), that allows users to easily assess the similarity of a pair of datasets using well-founded, commonly used statistic methods. COMPYDA guides users through univariate and multivariate analyses and helps them understand and explain dataset differences to ascertain a compatible dataset for further training. The tool is available at: https://cbia.fi.muni.cz/compyda/

Návaznosti

EF18_046/0016045, projekt VaV
Název: Modernizace národní infrastruktury pro biologické a medicínské zobrazování Czech-BioImaging
MUNI/A/1592/2023, interní kód MU
Název: Modelování, analýza a verifikace (2024)
Investor: Masarykova univerzita, Modelování, analýza a verifikace (2024)
90250, velká výzkumná infrastruktura
Název: Czech-BioImaging III