J 2023

RBP-Tar – a searchable database for experimental RBP binding sites

GREŠOVÁ, Katarína; Tomáš RAČEK; Vlastimil MARTINEK; David ČECHÁK; Radka SVOBODOVÁ et al.

Základní údaje

Originální název

RBP-Tar – a searchable database for experimental RBP binding sites

Autoři

Vydání

F1000Research, Taylor and Francis, 2023, 2046-1402

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14740/23:00137644

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

EID Scopus

Klíčová slova anglicky

RNA Binding Proteins; CLIP; RBP; Web-server

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 4. 11. 2025 10:07, Mgr. Eva Dubská

Anotace

V originále

RNA-binding proteins (RBPs) play a critical role in regulating gene expression by binding to specific sites on RNA molecules. Identifying these binding sites is crucial for understanding the many functions of RBPs in cellular function, development and disease. Current experimental methods for identifying RBP binding sites, such as ultra-violet (UV) crosslinking and immunoprecipitation (CLIP), and especially the enhanced CLIP (eCLIP) protocol, were developed to identify authentic RBP binding sites experimentally.

Návaznosti

LM2018140, projekt VaV
Název: e-Infrastruktura CZ (Akronym: e-INFRA CZ)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, e-Infrastruktura CZ
LM2023067, projekt VaV
Název: Národní centrum lékařské genomiky
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, NCLG: Národní centrum lékařské genomiky
90131, velká výzkumná infrastruktura
Název: ELIXIR-CZ II