R 2024

Brain MRI Screening Tool

STOKLASA, Roman a Ioannis STATHOPOULOS

Základní údaje

Originální název

Brain MRI Screening Tool

Autoři

STOKLASA, Roman ORCID a Ioannis STATHOPOULOS

Vydání

2024

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Software

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14330/24:00138569

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

MRI; brain; tumor; screening; FL; federated; learning

Technické parametry

Veřejně dostupný open-source software vydaný pod GNU General Public License

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 21. 1. 2025 12:46, RNDr. Roman Stoklasa, Ph.D.

Anotace

V originále

We are presenting an automatic brain MRI Screening Tool, and we are demonstrating its capabilities for detecting tumor-like pathologies. It is the first version on the path toward a robust multi-pathology screening solution. The tool supports Federated Learning, so multiple institutions may contribute to the model without disclosing their private data. The tool detected 98% of brain tumors in our testing dataset (102 patients) with a precision of 91 %, achieving a segmentation Dice score of more than 0.88. We offer a self-contained software package as a Docker image, which can be run for your MRI data to obtain predictions.

Návaznosti

LM2023050, projekt VaV
Název: Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Czech BioImaging: Národní výzkumná infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování
NU21-08-00359, projekt VaV
Název: Klasifikace mozkových tumorů pomocí pokročilých metod analýzy dat multimodálního MR zobrazení difuze
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Klasifikace mozkových tumorů pomocí pokročilých metod analýzy dat multimodálního MR zobrazení difuze, Podprogram 1 - standardní