R 2024

Calfitter 2.0

KUNKA, Antonín; Dávid LACKO; Jan DVORSKÝ; Jiří DAMBORSKÝ; Zbyněk PROKOP et al.

Základní údaje

Originální název

Calfitter 2.0

Název anglicky

Calfitter 2.0

Autoři

Vydání

2024

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Software

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/24:00138658

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

protein: thermal denaturation: protein unfolding: aggregation; webserver; dataset

Technické parametry

Doposud je využíváno interně k výzkumným účelům.
Změněno: 28. 1. 2025 08:10, prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

Anotace

ORIG EN

V originále

CalFitter 2.0 je vylepšená verze webového serveru CalFitter, která integruje rozklad singulárních hodnot (SVD) souborů spektrálních dat o více vlnových délkách do své globální fitovací pipeline. Tato aktualizace umožňuje fitování zpracovaných složek SVD spolu s dalšími typy experimentálních dat, což poskytuje spektrální otisky makrostavů během rozkládání proteinů. Plně automatizovaný modul analýzy SVD je navržen pro uživatelsky přívětivou interakci a nevyžaduje žádné předchozí matematické znalosti. Nový průvodce nahráváním dat navíc zjednodušuje proces, díky němuž mohou uživatelé rychle nahrát více datových sad. Tato vylepšení výrazně zlepšují uživatelský komfort a vytvářejí z CalFitteru 2.0 jedinečný a robustní nástroj pro analýzu dat z tepelné denaturace proteinů.

Anglicky

CalFitter 2.0 is an enhanced version of the CalFitter webserver that integrates singular value decomposition (SVD) of multi-wavelength spectral datasets into its global fitting pipeline. This upgrade enables the fitting of processed SVD components alongside other experimental data types, providing valuable spectral fingerprints of macrostates during protein unfolding. The fully automated SVD analysis module is designed for user-friendly interaction, requiring no prior mathematical knowledge. Additionally, a new data uploading wizard streamlines the process for users to upload multiple datasets quickly. These improvements significantly enhance the user experience, establishing CalFitter 2.0 as a unique and robust tool for analyzing protein thermal denaturation data.

Návaznosti

LM2023049, projekt VaV
Název: Český národní uzel Evropské sítě infrastruktur klinického výzkumu
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CZECRIN - Czech National Node to the European Clinical Research Infrastructure Network