2024
Kód fyziologického farmakokinetického modelu (PBPK) v MatLabu pro simulaci časově závislých koncentrací chemických látek v lidském těle
DOMÍNGUEZ-ROMERO, Elena; Stanislav MAZURENKO; Martin SCHERINGER; Vítor A.P. MARTINS DOS SANTOS; Chris T. EVELO et al.Základní údaje
Originální název
Kód fyziologického farmakokinetického modelu (PBPK) v MatLabu pro simulaci časově závislých koncentrací chemických látek v lidském těle
Název anglicky
Physiologically Based Pharmacokinetic (PBPK) model code in MatLab for simulating time-dependent concentrations of a chemical in a human body
Autoři
DOMÍNGUEZ-ROMERO, Elena; Stanislav MAZURENKO; Martin SCHERINGER; Vítor A.P. MARTINS DOS SANTOS; Chris T. EVELO; Mihail ANTON; John M HANCOCK; Anže ŽUPANIČ a Maria SUAREZ-DIEZ
Vydání
2024
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Software
Obor
10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/24:00138663
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
pharmacokinetics; xenobiotics; partition coefficients; interoperability; MatLab
Technické parametry
Doposud je využíváno interně k výzkumným účelům.
Změněno: 4. 4. 2025 08:02, prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
V originále
Tříkompartmentový fyziologický farmakokinetický model (PBPK) kódovaný v MatLabu zahrnuje krev, játra a společné zastoupení dalších tělesných tkání, čímž se odchyluje od tradičních návrhů s důrazem na krev. Model je postaven na koncepčním rámci navrženém Uptonem et al. (2016), ale využívá aktualizované hodnoty parametrů pro dospělé jedince a zavádí rozdělovací koeficienty, čímž zvyšuje přesnost distribuce. Jeho jednoduchost a komplexnost podporuje lepší porozumění a zajišťuje interoperabilitu a opakované použití, přičemž dodržuje soubor pravidel „Minimální informace požadované při anotaci biochemických modelů (MIRIAM)“ a současná doporučení pro vývoj modelů PBPK.
Anglicky
A three-compartment Physiologically Based Pharmacokinetic (PBPK) model coded in MatLab incorporates blood, liver, and a collective representation of other body tissues, diverging from traditional designs by emphasising blood. The model is built on the conceptual framework proposed by Upton et al. (2016) but utilises updated parameter values for adult humans and introduces partition coefficients, enhancing distribution accuracy. Its simplicity and comprehensiveness promote better understanding and ensure interoperability and reusability, adhering to “the Minimum information requested in the annotation of biochemical models (MIRIAM)” set of rules and contemporary recommendations for PBPK model development.
Návaznosti
| LM2023049, projekt VaV |
|