Fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro
halogenalkandehalogenázy

G 2024

Fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro halogenalkandehalogenázy

SLÁNSKÁ, Michaela; Lenka ŠTACKOVÁ; Sérgio Manuel MARQUES; P. ŠTACKO; Marek MARTÍNEK et al.

Základní údaje

Originální název

Fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro halogenalkandehalogenázy

Název anglicky

Azobenzene-based photoswitchable substrates for haloalkane dehalogenases

Autoři

SLÁNSKÁ, Michaela; Lenka ŠTACKOVÁ; Sérgio Manuel MARQUES; P. ŠTACKO; Marek MARTÍNEK; Luboš JÍLEK; Martin TOUL; Jiří DAMBORSKÝ; David BEDNÁŘ; Petr KLÁN a Zbyněk PROKOP

Vydání

2024

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)

Obor

10608 Biochemistry and molecular biology

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/24:00138664

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

photoswitch; enzyme; probe; azobenzene; transient kinetics; mechanism; time-resolved spectroscopy

Technické parametry

Doposud je využíváno interně k výzkumným účelům.

Změněno: 4. 4. 2025 12:36, prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

Anotace

ORIG EN

V originále

Vyvinuli jsme fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro halogenalkandehalogenázy (E.C. 3.8.1.5, HLDs), což jsou významné enzymy ze superrodiny α/β-hydroláz. Tyto biokatalyzátory, které přeměňují halogenované uhlovodíky na alkoholy, mají široké využití v dekontaminaci, bioremediaci, biosenzorech, výrobě farmaceutik či zobrazování buněk a proteinů. Azobenzenový substrát umožňuje v laserově řízeném experimentu s pre-steady-state kinetikou detailní analýzy katalytického mechanismu HLDs a jejích mutantů. Nový substrát bude jako detekční sonda využit v časově rozlišené femtosekundové krystalografii k přesnému monitorování strukturního průběhu katalytických reakcí.

Anglicky

We have developed an azobenzene-based photoactivatable substrate for haloalkane dehalogenases (E.C. 3.8.1.5, HLDs), important enzymes of the α/β-hydrolase superfamily. These biocatalysts, which convert halogenated hydrocarbons into alcohols, have wide applications in decontamination, bioremediation, biosensors, pharmaceutical production, and cell and protein imaging. The azobenzene substrate allows detailed analyses of the catalytic mechanism of HLDs and its mutants in a laser-controlled experiment with pre-steady-state kinetics. The new substrate will be used as a detection probe in time-resolved femtosecond crystallography to accurately monitor the structural progress of catalytic reactions.

Návaznosti

EF17_043/0009632, projekt VaV

Název: CETOCOEN Excellence

Citovat

SLÁNSKÁ, Michaela; Lenka ŠTACKOVÁ; Sérgio Manuel MARQUES; P. ŠTACKO; Marek MARTÍNEK; Luboš JÍLEK; Martin TOUL; Jiří DAMBORSKÝ; David BEDNÁŘ; Petr KLÁN a Zbyněk PROKOP. Fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro halogenalkandehalogenázy. 2024.

@techreport{2471877,
   author = {Slánská, Michaela and Štacková, Lenka and Marques, Sérgio Manuel and Štacko, P. and Martínek, Marek and Jílek, Luboš and Toul, Martin and Damborský, Jiří and Bednář, David and Klán, Petr and Prokop, Zbyněk},
   keywords = {photoswitch; enzyme; probe; azobenzene; transient kinetics; mechanism; time-resolved spectroscopy},
   language = {cze},
   institution = {Masarykova univerzita},
   organization = {Masarykova univerzita},
   title = {Fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro halogenalkandehalogenázy},
   url = {https://loschmidt.chemi.muni.cz/},
   year = {2024}
}

TY  - RPRT
ID  - 2471877
AU  - Slánská, Michaela - Štacková, Lenka - Marques, Sérgio Manuel - Štacko, P. - Martínek, Marek - Jílek, Luboš - Toul, Martin - Damborský, Jiří - Bednář, David - Klán, Petr - Prokop, Zbyněk
PY  - 2024
TI  - Fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro halogenalkandehalogenázy
KW  - photoswitch
KW  - enzyme
KW  - probe
KW  - azobenzene
KW  - transient kinetics
KW  - mechanism
KW  - time-resolved spectroscopy
UR  - https://loschmidt.chemi.muni.cz/
N2  - Vyvinuli jsme fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro halogenalkandehalogenázy (E.C. 3.8.1.5, HLDs), což jsou významné enzymy ze superrodiny α/β-hydroláz. Tyto biokatalyzátory, které přeměňují halogenované uhlovodíky na alkoholy, mají široké využití v dekontaminaci, bioremediaci, biosenzorech, výrobě farmaceutik či zobrazování buněk a proteinů. Azobenzenový substrát umožňuje v laserově řízeném experimentu s pre-steady-state kinetikou detailní analýzy katalytického mechanismu HLDs a jejích mutantů. Nový substrát bude jako detekční sonda využit v časově rozlišené femtosekundové krystalografii k přesnému monitorování strukturního průběhu katalytických reakcí.
ER  -

SLÁNSKÁ, Michaela; Lenka ŠTACKOVÁ; Sérgio Manuel MARQUES; P. ŠTACKO; Marek MARTÍNEK; Luboš JÍLEK; Martin TOUL; Jiří DAMBORSKÝ; David BEDNÁŘ; Petr KLÁN a Zbyněk PROKOP. \textit{Fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro halogenalkandehalogenázy}. 2024.

Přehled o publikaci