Stanovení polymorfizmu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci k
meticilinu a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA genů u
Staphylococcus aureus metodou PCR

D 2000

Stanovení polymorfizmu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci k meticilinu a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA genů u Staphylococcus aureus metodou PCR

HOBZA, Roman; Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK

Základní údaje

Originální název

Stanovení polymorfizmu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci k meticilinu a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA genů u Staphylococcus aureus metodou PCR

Název anglicky

Estimation of polymorphism in coagulase and methicillin-resistance genes and 16S-23S rDNA intergenic spacers in Staphylococcus aureus by PCR amplification

Autoři

HOBZA, Roman; Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK

Vydání

1. vydání, 2000. Brno, 4th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists. Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new century, s. 49-50, 2000

Nakladatel

Masarykova univerzita

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/00:00002000

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

80-210-2266-3

Změněno: 2. 1. 2001 16:15, prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Kmeny Staphylococcus aureus rezistentní k meticilinu (MRSA) jsou častým zdrojem nozokomiálních infekcí představujících problém ve zdravotnických zařízeních. Pro léčbu má prvořadý význam rychlá a spolehlivá identifikace a charakterizace původce nákazy a jeho odlišení od nepatogenních kmenů. Bylo vybráno 11 kmenů MRSA v různých nemocnicích. Metodou PCR byla prokázána existence genu mecA, jež zodpovídá za rezistenci k meticilinu. Velikost amplifikačních produktů byla stejná u všech kmenů a po použití několika restrikčních endonukleáz nebyly zjištěny rozdíly v jejich nukleotidové sekvenci. Dále byly amplifikovány oblasti genu pro tvorbu koagulázy a regulační oblasti femA ovlivňující rezistenci k meticilinu. U amplifikačích produktů genu pro tvorbu koagulázy byl zjištěn polymorfismus délky restrikčních fragmentů, který však neumožňuje rozlišení všech kmenů. Restrikční analýza neprokázala odlišnosti v amplifikovaných sekvencích. Pro další analýzy, které by umožnily odlišit studované kmeny metodou PCR, byly použity primery, které amplifikují oblasti mezi geny pro 16S-23S rRNA. Tyto tzv. mezerníky jsou u S. aureus variabilní v počtu i velikosti. Výsledkem PCR byly pouze dva typy produktů, což koresponduje s hypotézou o monoklonálním původu MRSA. Pro potvrzení vhodnosti této metody k určování rozdílů v genomu bakterií bylo použito 13 kmenů S. aureus, reprezentujících 13 různých makrorestrikčních skupin. Amplifikace mezerníků prokázala odlišnosti mezi všemi kmeny. Na základě srovnání spekter PCR-produktů byl sestrojen dendrogram, znázorňující genetickou příbuznost kmenů, který byl porovnán s dendrogramem získaným z výsledků makrorestrikční analýzy DNA kmenů pomocí pulzní gelové elektroforézy. Mezi kmeny MRSA byl zjištěn kmen, jehož spektrum PCR-produktů se shoduje se spektrem produktů jednoho ze zástupců uvedených makrorestrikčních skupin.

Anglicky

neuvedena

Návaznosti

GA301/97/1192, projekt VaV

Název: Molekulární identifikace a diagnostika stafylokoků způsobující nozokomiální infekce

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární identifikace a diagnostika stafylokoků způsobující nozokomiální infekce

MSM 143100008, záměr

Název: Genomy a jejich funkce

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Genomy a jejich funkce

Citovat

HOBZA, Roman; Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Stanovení polymorfizmu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci k meticilinu a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA genů u Staphylococcus aureus metodou PCR. In 4th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists. Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new century. 1. vydání, 2000. Brno: Masarykova univerzita, 2000, s. 49-50. ISBN 80-210-2266-3.

@inproceedings{254872,
   author = {Hobza, Roman and Doškař, Jiří and Pantůček, Roman},
   address = {Brno},
   booktitle = {4th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists. Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new century},
   edition = {1. vydání, 2000},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {80-210-2266-3},
   pages = {49-50},
   publisher = {Masarykova univerzita},
   title = {Stanovení polymorfizmu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci k meticilinu a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA genů u Staphylococcus aureus metodou PCR},
   year = {2000}
}

TY  - CONF
ID  - 254872
AU  - Hobza, Roman - Doškař, Jiří - Pantůček, Roman
PY  - 2000
TI  - Stanovení polymorfizmu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci k meticilinu a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA genů u Staphylococcus aureus metodou PCR
PB  - Masarykova univerzita
CY  - Brno
SN  - 8021022663
N2  - Kmeny Staphylococcus aureus rezistentní k meticilinu (MRSA) jsou častým zdrojem nozokomiálních infekcí představujících problém ve zdravotnických zařízeních. Pro léčbu má prvořadý význam rychlá a spolehlivá identifikace a charakterizace původce nákazy a jeho odlišení od nepatogenních kmenů. Bylo vybráno 11 kmenů MRSA v různých nemocnicích. Metodou PCR byla prokázána existence genu mecA, jež zodpovídá za rezistenci k meticilinu. Velikost amplifikačních produktů byla stejná u všech kmenů a po použití několika restrikčních endonukleáz nebyly zjištěny rozdíly v jejich nukleotidové sekvenci. Dále byly amplifikovány oblasti genu pro tvorbu koagulázy a regulační oblasti femA ovlivňující rezistenci k meticilinu. U amplifikačích produktů genu pro tvorbu koagulázy byl zjištěn polymorfismus délky restrikčních fragmentů, který však neumožňuje rozlišení všech kmenů. Restrikční analýza neprokázala odlišnosti v amplifikovaných sekvencích. Pro další analýzy, které by umožnily odlišit studované kmeny metodou PCR, byly použity primery, které amplifikují oblasti mezi geny pro 16S-23S rRNA. Tyto tzv. mezerníky jsou u S. aureus variabilní v počtu i velikosti. Výsledkem PCR byly pouze dva typy produktů, což koresponduje s hypotézou o monoklonálním původu MRSA. Pro potvrzení vhodnosti této metody k určování rozdílů v genomu bakterií bylo použito 13 kmenů S. aureus, reprezentujících 13 různých makrorestrikčních skupin. Amplifikace mezerníků prokázala odlišnosti mezi všemi kmeny. Na základě srovnání spekter PCR-produktů byl sestrojen dendrogram, znázorňující genetickou příbuznost kmenů, který byl porovnán s dendrogramem získaným z výsledků makrorestrikční analýzy DNA kmenů pomocí pulzní gelové elektroforézy. Mezi kmeny MRSA byl zjištěn kmen, jehož spektrum PCR-produktů se shoduje se spektrem produktů jednoho ze zástupců uvedených makrorestrikčních skupin.
ER  -

HOBZA, Roman; Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Stanovení polymorfizmu genů pro tvorbu koagulázy, rezistenci k meticilinu a 16S-23S mezerníkových oblastí rDNA genů u Staphylococcus aureus metodou PCR. In \textit{4th Workshop of Biochemists and Molecular Biologists. Biochemistry and molecular biology on the threshold of a new century}. 1. vydání, 2000. Brno: Masarykova univerzita, 2000, s.~49-50. ISBN~80-210-2266-3.

Přehled o publikaci