Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aurerus pomocí druhově
specifických sond

D 2001

Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aurerus pomocí druhově specifických sond

ORÁČOVÁ, Eva; Veronika KVARDOVÁ; Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ

Základní údaje

Originální název

Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aurerus pomocí druhově specifických sond

Název anglicky

Prophage detection in strains of Staphylococcus aurerus by phage species-specific probes

Autoři

ORÁČOVÁ, Eva; Veronika KVARDOVÁ; Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ

Vydání

Košice - Praha, 22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms, s. 262-262, 2001

Nakladatel

Czechoslovak Society for Microbiology

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Slovensko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/01:00005404

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Změněno: 30. 10. 2003 15:12, prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

V genomech typizačních fágů S. aureus mezinárodní řady byly vy-hledány sekvence specifické pro fágové druhy séroskupin A (fág 3A), B (fág 53), F (fág 77) a L (fág 187). Hybridizační sondy připravené z těchto sekvencí detekují v lyzogenních kmenench S. aureus profágy příslušných fágových druhů. K usnadnění detekce profágů byly pro každou ze specifických sekvencí navrženy PCR-primery, umožňující získat pro každý fágový druh amplifikační produkt charakteristické velikosti. Optimalizací sady primerů byla zavedena multiplex PCR pro přímý důkaz přítomnosti profágů jednotlivých druhů v jediné PCR-reakci. Metoda detekce profágů byla ověřena jak na uměle lyzo-genizovaných kmenech připravených na našem pracovišti, tak na kmenech z klinického materiálu. S využitím této techniky byly proká-zány významné rozdíly v obsahu profágů u meticilin-rezistentních kmenů. Srovnání diskriminační schopnosti několika genotypizačních metod (PFGE, ribotypizace) prokázalo, že stanovení rozdílů v obsahu profágů představuje velmi citlivou typizační metodu, která je vhodná i pro odlišení blízce příbuzných kmenů.

Anglicky

in Czech

Návaznosti

MSM 143100008, záměr

Název: Genomy a jejich funkce

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Genomy a jejich funkce

Citovat

ORÁČOVÁ, Eva; Veronika KVARDOVÁ; Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ. Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aurerus pomocí druhově specifických sond. In 22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms. Košice - Praha: Czechoslovak Society for Microbiology, 2001, s. 262.

@inproceedings{390531,
   author = {Oráčová, Eva and Kvardová, Veronika and Pantůček, Roman and Doškař, Jiří},
   address = {Košice - Praha},
   booktitle = {22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms},
   language = {cze},
   location = {Košice - Praha},
   pages = {262-262},
   publisher = {Czechoslovak Society for Microbiology},
   title = {Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aurerus pomocí druhově specifických sond},
   year = {2001}
}

TY  - CONF
ID  - 390531
AU  - Oráčová, Eva - Kvardová, Veronika - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří
PY  - 2001
TI  - Detekce profágů v kmenech Staphylococcus aurerus pomocí druhově specifických sond
PB  - Czechoslovak Society for Microbiology
CY  - Košice - Praha
N2  - V genomech typizačních fágů S. aureus mezinárodní řady byly vy-hledány sekvence specifické pro fágové druhy séroskupin A (fág 3A), B (fág 53), F (fág 77) a L (fág 187). Hybridizační sondy připravené z těchto sekvencí detekují v lyzogenních kmenench S. aureus profágy příslušných fágových druhů. K usnadnění detekce profágů byly pro každou ze specifických sekvencí navrženy PCR-primery, umožňující získat pro každý fágový druh amplifikační produkt charakteristické velikosti. Optimalizací sady primerů byla zavedena multiplex PCR pro přímý důkaz přítomnosti profágů jednotlivých druhů v jediné PCR-reakci. Metoda detekce profágů byla ověřena jak na uměle lyzo-genizovaných kmenech připravených na našem pracovišti, tak na kmenech z klinického materiálu. S využitím této techniky byly proká-zány významné rozdíly v obsahu profágů u meticilin-rezistentních kmenů. Srovnání diskriminační schopnosti několika genotypizačních metod (PFGE, ribotypizace) prokázalo, že stanovení rozdílů v obsahu profágů představuje velmi citlivou typizační metodu, která je vhodná i pro odlišení blízce příbuzných kmenů.
ER  -

ORÁČOVÁ, Eva; Veronika KVARDOVÁ; Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ. Detekce profágů v kmenech $<$I$>$Staphylococcus aurerus$<$/I$>$ pomocí druhově specifických sond. In \textit{22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms}. Košice - Praha: Czechoslovak Society for Microbiology, 2001, s.~262.

Přehled o publikaci