J 2003

Arrangement of chromosome 11 and 22 territories, EWSR1 and FLI-1 genes, and other genetic elements of these chromosomes in human lymphocytes and Ewing sarcoma cells

TASLEROVÁ, Renata; Stanislav KOZUBEK; Emilie LUKÁŠOVÁ; Pavla JIRSOVÁ; Eva BÁRTOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Arrangement of chromosome 11 and 22 territories, EWSR1 and FLI-1 genes, and other genetic elements of these chromosomes in human lymphocytes and Ewing sarcoma cells

Autoři

TASLEROVÁ, Renata (203 Česká republika); Stanislav KOZUBEK (203 Česká republika); Emilie LUKÁŠOVÁ (203 Česká republika); Pavla JIRSOVÁ (203 Česká republika); Eva BÁRTOVÁ (203 Česká republika) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika, garant)

Vydání

Human Genetics, 2003, 0340-6717

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Německo

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 4.022

Kód RIV

RIV/00216224:14330/03:00007922

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

human genome structure; interphase cell nuclei

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 7. 5. 2010 15:51, prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.

Anotace

V originále

Standard and repeated fluorescence in situ hybridization and high-resolution cytometry were used to study topographical parameters of chromosome 11 and 22 territories, EWSR1 and FLI1 genes, and other genetic elements of these chromosomes in human lymphocytes and Ewing sarcoma cells. HSA 11 and its elements (BCL1, FLI1, centromere) were found, on average, more peripherally in comparison with HSA 22 and investigated elements (BCR, EWSR1, centromere). After the elimination of fluctuations of chromosome territories in nuclear volume, it was found that genetic elements in most cases adhered to their territories. The investigated genetic elements of HSA 11 were found close to each other relative to the large molecular lengths among them. This finding indicates a higher degree of chromatin condensation of at least a part of HSA 11 compared with HSA 22. In general, there is no correlation between the physical and molecular distance of two loci of the same chromosome territory. The topographical parameters of the EWSR1 and FLI1 genes do not differ substantially for G0-lymphocytes, stimulated lymphocytes and Ewing sarcoma cells. The fusion genes pertaining to both derivative chromosomes 11 and 22 in Ewing sarcoma cell nuclei are shifted to the midway position between the native EWSR1 and FLI1 genes. Comparing results obtained for the EWSR1/FLI1 and ABL1/BCR genes in samples of patients suffering from Ewing sarcoma or chronic myelogenous leukaemia, it can be concluded that the mean positions of the fusion genes are determined by the final structure of the chimeric chromosomes and do not depend on the location of the translocation event.

Návaznosti

GA301/01/0186, projekt VaV
Název: Studium lokální kontroly exprese genů pomocí spektrální mikroskopie a analýzy obrazu
Investor: Grantová agentura ČR, Studium lokální kontroly exprese genů pomocí spektrální mikroskopie a analýzy obrazu
IBS5004010, projekt VaV
Název: Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
Investor: Akademie věd ČR, Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
MSM 143300002, záměr
Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
NC5955, projekt VaV
Název: Jak může přispět studium prostorového uspořádání specifických genetických lokusů v jádře buněk zdravých a maligních tkání k diagnostice a léčbě solidních tumorů.
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Jak může přispět studium prostorového uspořádání specifických genetických lokusů v jádře buněk zdravých a maligních tkání k diagnostice a léčbě solidních tumorů