Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech 
Staphylococcus aureus

D 2003

Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech Staphylococcus aureus

PILOUSOVÁ, Lenka, Roman PANTŮČEK and Jiří DOŠKAŘ

Basic information

Original name

Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech Staphylococcus aureus

Name (in English)

Preparation of an universal probe for prophage detection in Staphylococcus aureus strains

Authors

PILOUSOVÁ, Lenka (203 Czech Republic), Roman PANTŮČEK (203 Czech Republic) and Jiří DOŠKAŘ (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Brno, VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, p. 65-66, 2003

Publisher

Masarykova univerzita

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

URL

RIV identification code

RIV/00216224:14310/03:00008582

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

80-210-3053-4

Keywords in English

Bacterial Typing Techniques; DNA; Bacteriophages; Staphylococcus aureus; Lysogeny; Multiplex PCR; Prophage detection

Abstract

ORIG EN

V originále

Většina kmenů patogenního bakteriálního druhu Staphylococcus aureus je lyzogenních a obsahuje ve svém genomu jednoho nebo více profágů. Přítomnost profágů vede ke změnám fenotypových znaků hostitelských kmenů (k tzv. lyzogenním konverzím), které se často týkají jejich patogenity a virulence, anebo navozují necitlivost k dalším fágům. Cílem práce bylo identifikovat genomovou sekvenci společnou pro fágové druhy 3A, 53 a 77 reprezentující sérologické skupiny A, B a F mírných bakteriofágů mezinárodní standardní řady druhu S. aureus a využít ji k přípravě molekulární sondy pro detekci profágových sekvencí v genomech hostitelských kmenů. Vyhledání společné sekvence bylo provedeno reciprokou hybridizací značených celkových genomových DNA fágů 3A a 77 k restrikčním spektrům (HindIII/XbaI) DNA fágů 3A, 53 a 77. Hybridizující restrikční fragmenty byly klonovány a použity jako sondy k ověření přítomnosti identických sekvencí v genomech všech fágů mezinárodní řady. Z testovaných restrikčních fragmentů byl vybrán fragment HindIII/XbaI-F z fága 3A, který hybridizoval k většině fágových DNA (100% zástupců sérologické skupiny A, 100% sérologické skupiny F a 36% sérologické skupiny B fágů mezinárodní standardní řady). Byla stanovena jeho sekvence a srovnána s dosud známými sekvencemi stafylokokových bakteriofágů a profágů identifikovaných v genomech S. aureus. Tato sekvence odpovídá části genu pro integrázu a nekódující oblasti mezi tímto genem a genem pro excizionázu. Připravená sonda je vhodná pro identifikaci všech profágů séroskupin A a F a většiny profágů séroskupiny B v kmenech S. aureus . Výsledky práce ukázaly, že genomy bakteriofágů S. aureus jednotlivých séroskupin obsahují jen velmi omezený počet vzájemně homologních sekvencí DNA, mezi něž patří zejména geny, které se týkají integrace bakteriofágových genomů do genomu hostitelských kmenů.

In English

neuvedeno

Links

MSM 143100008, plan (intention)

Name: Genomy a jejich funkce

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Genomes and their functions

Citovat

PILOUSOVÁ, Lenka, Roman PANTŮČEK and Jiří DOŠKAŘ. Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech Staphylococcus aureus (Preparation of an universal probe for prophage detection in Staphylococcus aureus strains). In VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita, 2003, p. 65-66. ISBN 80-210-3053-4.

@inproceedings{483806,
   author = {Pilousová, Lenka and Pantůček, Roman and Doškař, Jiří},
   address = {Brno},
   booktitle = {VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů},
   keywords = {Bacterial Typing Techniques; DNA; Bacteriophages; Staphylococcus aureus; Lysogeny; Multiplex PCR; Prophage detection},
   language = {cze},
   location = {Brno},
   isbn = {80-210-3053-4},
   pages = {65-66},
   publisher = {Masarykova univerzita},
   title = {Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech Staphylococcus aureus},
   url = {http://orion.chemi.muni.cz/Setkani/setkani7/index.htm},
   year = {2003}
}

TY  - JOUR
ID  - 483806
AU  - Pilousová, Lenka - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří
PY  - 2003
TI  - Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech Staphylococcus aureus
PB  - Masarykova univerzita
CY  - Brno
SN  - 8021030534
KW  - Bacterial Typing Techniques
KW  - DNA
KW  - Bacteriophages
KW  - Staphylococcus aureus
KW  - Lysogeny
KW  - Multiplex PCR
KW  - Prophage detection
UR  - http://orion.chemi.muni.cz/Setkani/setkani7/index.htm
N2  - Většina kmenů patogenního bakteriálního druhu Staphylococcus aureus je lyzogenních a obsahuje ve svém genomu jednoho nebo více profágů. Přítomnost profágů vede ke změnám fenotypových znaků hostitelských kmenů (k tzv. lyzogenním konverzím), které se často týkají jejich patogenity a virulence, anebo navozují necitlivost k dalším fágům. Cílem práce bylo identifikovat genomovou sekvenci společnou pro fágové druhy 3A, 53 a 77 reprezentující sérologické skupiny A, B a F mírných bakteriofágů mezinárodní standardní řady druhu S. aureus a využít ji k přípravě molekulární sondy pro detekci profágových sekvencí v genomech hostitelských kmenů. Vyhledání společné sekvence bylo provedeno reciprokou hybridizací značených celkových genomových DNA fágů 3A a 77 k restrikčním spektrům (HindIII/XbaI) DNA fágů 3A, 53 a 77. Hybridizující restrikční fragmenty byly klonovány a použity jako sondy k ověření přítomnosti identických sekvencí v genomech všech fágů mezinárodní řady. Z testovaných restrikčních fragmentů byl vybrán fragment HindIII/XbaI-F z fága 3A, který hybridizoval k většině fágových DNA (100% zástupců sérologické skupiny A, 100% sérologické skupiny F a 36% sérologické skupiny B fágů mezinárodní standardní řady). Byla stanovena jeho sekvence a srovnána s dosud známými sekvencemi stafylokokových bakteriofágů a profágů identifikovaných v genomech S. aureus. Tato sekvence odpovídá části genu pro integrázu a nekódující oblasti mezi tímto genem a genem pro excizionázu. Připravená sonda je vhodná pro identifikaci všech profágů séroskupin A a F a většiny profágů séroskupiny B v kmenech S. aureus . Výsledky práce ukázaly, že genomy bakteriofágů S. aureus jednotlivých séroskupin obsahují jen velmi omezený počet vzájemně homologních sekvencí DNA, mezi něž patří zejména geny, které se týkají integrace bakteriofágových genomů do genomu hostitelských kmenů.
ER  -

PILOUSOVÁ, Lenka, Roman PANTŮČEK and Jiří DOŠKAŘ. Příprava univerzální sondy pro detekci profágů v kmenech $<$I$>$ Staphylococcus aureus$<$/I$>$ (Preparation of an universal probe for prophage detection in $<$I$>$Staphylococcus aureus$<$/I$>$ strains). In \textit{VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů}. Brno: Masarykova univerzita, 2003, p.~65-66. ISBN~80-210-3053-4.

Detailed Information on Publication Record