PANTŮČEK, Roman. Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně. In ŘEHOUT, V. Pedagogický software. První vydání. České Budějovice: Scientific Pedagogical Publishing, 2004, s. 551-554. ISBN 80-85645-49-1.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně
Název anglicky Practical course of bioinformatics (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) at Faculty of Science, Masaryk university in Brno
Autoři PANTŮČEK, Roman (203 Česká republika, garant).
Vydání První vydání. České Budějovice, Pedagogický software, od s. 551-554, 4 s. 2004.
Nakladatel Scientific Pedagogical Publishing
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/04:00010118
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 80-85645-49-1
Klíčová slova anglicky bioinformatics; genomics; proteomics; education
Štítky bioinformatics, Education, genomics, proteomics
Změnil Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 10. 6. 2004 11:16.
Anotace
Bioinformatika je nová disciplína na rozhraní počítačových věd, informačních technologií, matematiky a biologie. Termín bioinformatika se objevil poprvé až v roce 1991 a představuje spojení technologií z oblasti molekulární biologie a oblasti informačních technologií u nichž došlo v posledních letech k explozivnímu růstu nových poznatků. Zahrnuje studium a praktické uchovávání, vyhledávání, zobrazování, manipulaci a modelování biologických dat (Tabulka 1). Neodmyslitelnou součástí infrastruktury bioinformatiky je komunikační prostředek umožňující rychlý přenos obrovského množství dat a současně poskytovanou všeobecnou dostupnost k těmto datům pro tisíce lidí. V závěru dvacátého století se tímto prostředkem stal internet a obecně používaným rozhraním je webový prohlížeč, umožňující pracovat s hypertextovými a hypergrafickými prezentacemi včetně výpočetních nástrojů, podstatně přispívajících ke stanovení vztahů, struktury a funkce informačních biomakromolekul a jejich role v biologických procesech. Na internetu existuje řada kolekcí shromažďujících odkazy na volně dostupné analytické nástroje bioinformatiky. V tomto příspěvku je uvedena výuková stránka pro cvičení k předmětu Úvod do bioinformatiky, který je zařazen do povinné výuky pro magisterský studijní obor molekulární biologie a genetika na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity v Brně. Cílem kurzu je zvládnutí běžných aplikací bioinformatiky potřebných pro zpracování diplomové práce z molekulární biologie, a především seznámení posluchačů s dostupnými informačními službami pro molekulární biologii. Stránka je umístěna na URL adrese http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/ a je členěná do 11 samostatných témat: Literární informační zdroje pro biomedicínské obory; Databázové zdroje pro molekulární biologii, textové vyhledávání v databázích; Metody používané při sekvencování genomů a analytické nástroje; Restrikční analýza a návrh PCR-primerů a oligonukleotidů; Hledání v databázích sekvencí nukleových kyselin: nástroje pro lokální seřazení sekvencí; Nástroje mnohonásobné a globální seřazení sekvencí DNA a proteinů; Fylogenetická analýza založená na srovnávání konzervativních genů; Počítačové vyhledávání genů a jiných funkčních oblastí genomu; Analýza sekundární struktury RNA; Klasifikace proteinů a identifikace jejich funkcí.
Anotace anglicky
neuvedena
Návaznosti
LB98226, projekt VaVNázev: Vybudování informačního centra pro biochemický a molekulárně biologický výzkum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vybudování informačního centra pro biochemický a molekulárně biologický výzkum
VytisknoutZobrazeno: 3. 5. 2024 18:21